More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0106 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0106  30S ribosomal protein S8P  100 
 
 		 133 aa  271  3e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000161976  unclonable  0.000000416476 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1763  ribosomal protein S8  80.45 
 
 		 133 aa  235  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0240  30S ribosomal protein S8P  55.73 
 
 		 129 aa  153  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40222  Ribosomal protein S15a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  50.38 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1749  30S ribosomal protein S8P  54.14 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.247305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0176  30S ribosomal protein S8P  48.87 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1865  30S ribosomal protein S8P  48.87 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1257  30S ribosomal protein S8P  48.12 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0795  30S ribosomal protein S8P  45.11 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.264164 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0725  30S ribosomal protein S8P  48.87 
 
 		 130 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184195  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77100  predicted protein  45.86 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.289517  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70478  40S ribosomal protein S22  45.86 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466178  normal  0.0829523 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2009  30S ribosomal protein S8P  45.86 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02900  ribosomal protein 22 of the small subunit, putative  44.36 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.186026  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23691  predicted protein  45.11 
 
 		 130 aa  130  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0457  30S ribosomal protein S8P  48.87 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0241627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1399  30S ribosomal protein S8P  47.37 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0164  30S ribosomal protein S8P  46.62 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00187977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0659  30S ribosomal protein S8P  45.86 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182792  hitchhiker  0.000260035 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00907  40S ribosomal protein S22 (Broad)  43.61 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000254668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1259  30S ribosomal protein S8P  45.86 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0178453  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0547  30S ribosomal protein S8P  45.86 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.504569  normal  0.327923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0095  30S ribosomal protein S8P  47.37 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000305227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0579  30S ribosomal protein S8P  45.11 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229104  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0016  30S ribosomal protein S8P  45.11 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.66957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1713  30S ribosomal protein S8P  45.04 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0026409  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1506  ribosomal protein S8  45.74 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.05998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2238  30S ribosomal protein S8P  44.78 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000015081  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0096  30S ribosomal protein S8P  42.86 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.612982 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2434  30S ribosomal protein S8P  42.86 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2233  ribosomal protein S8  42.11 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0225  ribosomal protein S8  40.6 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668244  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1843  30S ribosomal protein S8P  37.59 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2307  30S ribosomal protein S8P  38.35 
 
 		 130 aa  100  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  34.07 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  31.85 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1855  30S ribosomal protein S8  31.72 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  30.37 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  30.71 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1444  30S ribosomal protein S8  31.03 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18582 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  30.95 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  30.71 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1346  30S ribosomal protein S8  31.03 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000055965  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  30 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  29.29 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  30.28 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  34.04 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  30.5 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  29.29 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  32.14 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  29.45 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  33.56 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1850  ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.84535e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  30.07 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  30.07 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  30.07 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  30 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  30.07 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  32.86 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  30.07 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  27.86 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  30.07 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  30.07 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  30.07 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  28.47 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1003  30S ribosomal protein S8  29.58 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000656681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  30.37 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  31.43 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  30.53 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03157  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000452809  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0407  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000202289  hitchhiker  0.00000218378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  32.62 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03108  hypothetical protein  28.17 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000188552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  29.37 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3622  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000167775  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1263  30S ribosomal protein S8  30 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  28.57 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0733  30S ribosomal protein S8  30.56 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00108537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  28.17 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>