More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0104 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 		 174 aa  350  4e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  68.45 
 
 		 179 aa  250  7e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  60.71 
 
 		 182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  51.5 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  51.76 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  52.94 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  51.18 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  50 
 
 		 179 aa  173  9e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  48.02 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  44.57 
 
 		 178 aa  171  5.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  46.59 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  48.17 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  48.17 
 
 		 167 aa  165  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  46.33 
 
 		 181 aa  164  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  45.76 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  45.76 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  44.91 
 
 		 169 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  47.17 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  42.68 
 
 		 176 aa  156  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  46.34 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  45.78 
 
 		 168 aa  155  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  46.58 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  43.35 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  42.59 
 
 		 175 aa  150  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  39.88 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  40.85 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  40.72 
 
 		 169 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  43.71 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  41.07 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  42.07 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  40.61 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.98 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  38.69 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  42.86 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  42.14 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  42.14 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  42.14 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  40.29 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  40.29 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  45.11 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  37.59 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  39.29 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  41.79 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  40.71 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  40.43 
 
 		 183 aa  97.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  40.43 
 
 		 183 aa  97.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  41.43 
 
 		 179 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  35.71 
 
 		 185 aa  97.4  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 188 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  40.71 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  40.71 
 
 		 180 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  38.57 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  39.26 
 
 		 192 aa  95.5  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  39.57 
 
 		 180 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  36.17 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  42.07 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  39.57 
 
 		 179 aa  94.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  42.96 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  37.59 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  35.97 
 
 		 180 aa  93.6  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  36.43 
 
 		 181 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  41.79 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  36.43 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  39.01 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  37.78 
 
 		 193 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  37.32 
 
 		 182 aa  92  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  37.59 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  41.79 
 
 		 184 aa  92  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  36.43 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  36.43 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  37.59 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  36.88 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  36.17 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  36.62 
 
 		 182 aa  91.7  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  34.53 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  35 
 
 		 180 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  36.43 
 
 		 179 aa  91.3  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  35 
 
 		 180 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  35 
 
 		 180 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  91.3  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  38.57 
 
 		 179 aa  91.3  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  37.14 
 
 		 190 aa  91.3  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0768  50S ribosomal protein L5  35.46 
 
 		 180 aa  90.9  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0251429  normal  0.0345896 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0445  50S ribosomal protein L5  37.04 
 
 		 179 aa  90.9  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0266949  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  37.59 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  37.86 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  36.17 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0600  50S ribosomal protein L5  42.22 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0797735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  37.24 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  36.17 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  34.29 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  37.59 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000823313  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0421  50S ribosomal protein L5  42.22 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.889596  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  36.17 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0506  50S ribosomal protein L5  37.04 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0585941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>