More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0095 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 		 140 aa  285  2e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  75.71 
 
 		 140 aa  229  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  62.5 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  62.5 
 
 		 158 aa  173  8e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  62.5 
 
 		 160 aa  173  9e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  61.76 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  54.23 
 
 		 187 aa  154  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  54.41 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  52.27 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  50.78 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  48.18 
 
 		 162 aa  137  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  48.84 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  50.77 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  45.26 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  45.26 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  45.26 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  49.61 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  45.26 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  50.77 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  47.73 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  42.22 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  42.22 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  41.3 
 
 		 136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  41.91 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  40 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  39.26 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  39.55 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  38.97 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  37.04 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  46.15 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  41.73 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  37.04 
 
 		 136 aa  103  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  43.7 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  48.05 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  48 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  42.35 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  56.6 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0222  30S ribosomal protein S19  44.16 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  47.37 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57474  predicted protein  52 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.576492  normal  0.012106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  43.42 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  44.16 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  46.75 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  46.75 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0230  30S ribosomal protein S19  45.33 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.17899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  42.11 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  46.75 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  58.82 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  46.05 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0677  30S ribosomal protein S19  52.38 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.082813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5075  30S ribosomal protein S19  47.37 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.273051 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  44.74 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0481  ribosomal protein S19  44.94 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  48.68 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  44.16 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0964  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279744  hitchhiker  0.00000111628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  43.3 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2170  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000043951  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  45.33 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1964  ribosomal protein S19  43.42 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0147162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  48.68 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0398  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0373  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2320  ribosomal protein S19  50.98 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000162124  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  47.37 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  41.57 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  45.33 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>