251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0091 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 341 aa  685    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  64.39 
 
 		 351 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  50 
 
 		 347 aa  321  9.999999999999999e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  46.8 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  44.87 
 
 		 342 aa  293  3e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  45.57 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  46.69 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  42.2 
 
 		 337 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  44.25 
 
 		 334 aa  261  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  40.65 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  42.65 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  40.82 
 
 		 337 aa  239  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  40.46 
 
 		 334 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  42.14 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  39.37 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  39.08 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  39.65 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  38.79 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  36.76 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  39.88 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  41.37 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  38.82 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  38.66 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  38.84 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  38.08 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  38.71 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  36.92 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  35.78 
 
 		 331 aa  194  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  34.76 
 
 		 392 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  33.6 
 
 		 390 aa  182  6e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.96 
 
 		 386 aa  179  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  32.61 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  31.71 
 
 		 389 aa  162  6e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  28.46 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  44.34 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  28.93 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  38.24 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  28.74 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  35.25 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  25.27 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04308  50S ribosomal protein L3 (AFU_orthologue; AFUA_4G06000)  33.77 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569761  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  28.35 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  31.97 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  27.27 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  33.61 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  38.05 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  35.65 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  25.31 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  33.61 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  27.2 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  35.71 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  25.4 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  32.23 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  28.03 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  39.42 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  24.9 
 
 		 210 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  34.44 
 
 		 209 aa  55.8  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  34.15 
 
 		 212 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  27.89 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  30.15 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  31.25 
 
 		 228 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  36.61 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  25.29 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1851  50S ribosomal protein L3  27.45 
 
 		 236 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722115 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  35.11 
 
 		 219 aa  54.3  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  35.56 
 
 		 211 aa  53.9  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  35.29 
 
 		 205 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  26.22 
 
 		 247 aa  53.9  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  34.82 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  32.31 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  34.82 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  34.82 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  34.82 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  34.82 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  34.82 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  34.82 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  35.14 
 
 		 220 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  35.92 
 
 		 207 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  34.82 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  31.82 
 
 		 238 aa  53.1  0.000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  38.24 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  27.2 
 
 		 212 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  32.52 
 
 		 219 aa  53.1  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  36.27 
 
 		 208 aa  53.1  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1340  50S ribosomal protein L3  33.88 
 
 		 205 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  24.8 
 
 		 214 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  34.04 
 
 		 216 aa  52.8  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2950  50S ribosomal protein L3  27.49 
 
 		 217 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000276942  decreased coverage  0.000000134206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  27.49 
 
 		 217 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000538385  hitchhiker  0.0000807722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  33.93 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  33.66 
 
 		 210 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  35.05 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  33.93 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  26.29 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0394  50S ribosomal protein L3  33.01 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0369  50S ribosomal protein L3  33.01 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  33.93 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  26.4 
 
 		 212 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  27.24 
 
 		 211 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  34.78 
 
 		 209 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>