14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0080 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0080  ribosomal biogenesis protein, containing Brix domain  100 
 
 		 159 aa  319  9.999999999999999e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.158541  hitchhiker  0.00026284 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1789  Brix domain protein  37.84 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0260354  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0833  ribosomal biogenesis protein  35.48 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0577893 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1056  Brix  37.63 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123368  hitchhiker  0.000000052203 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0920  ribosomal biogenesis protein  34.41 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1260  ribosomal biogenesis protein  38.24 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.837937  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1378  ribosomal biogenesis protein  32 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.745647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1940  ribosomal biogenesis protein  30.85 
 
 		 183 aa  44.3  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29310  predicted protein  32.81 
 
 		 291 aa  44.3  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1426  ribosomal biogenesis protein  35.29 
 
 		 164 aa  43.9  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1249  ribosomal biogenesis protein  35.29 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0706  ribosomal biogenesis protein  35.29 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90419  predicted protein  31.82 
 
 		 283 aa  42.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0411733  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51007  predicted protein  30.16 
 
 		 296 aa  41.2  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.612062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>