22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0071 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0071  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  289  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000262103  hitchhiker  0.00974404 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1798  Protein of unknown function DUF54  34.69 
 
 
149 aa  100  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.354083  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0389  hypothetical protein  29.92 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1280  hypothetical protein  34.88 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0651  hypothetical protein  35.61 
 
 
167 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.284614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1302  hypothetical protein  34.88 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1852  hypothetical protein  33.59 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1374  hypothetical protein  34.11 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1387  hypothetical protein  30.6 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1311  hypothetical protein  32.56 
 
 
167 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138336  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0938  hypothetical protein  32.59 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1513  hypothetical protein  30.37 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1934  Protein of unknown function DUF54  34.86 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1368  hypothetical protein  29.2 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1931  hypothetical protein  29.1 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0947  hypothetical protein  33.96 
 
 
174 aa  50.4  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0842  hypothetical protein  30.17 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.532651  normal  0.113262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0587  Protein of unknown function DUF54  32.08 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2396  Protein of unknown function DUF54  32.98 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.719157 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0766  hypothetical protein  31.78 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0525  hypothetical protein  32.41 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.678708  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0193  hypothetical protein  26.24 
 
 
151 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0279066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>