More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0069 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  100 
 
 		 400 aa  813    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  70.93 
 
 		 401 aa  608  1e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  52.9 
 
 		 399 aa  403  1e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  50.5 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  49.37 
 
 		 419 aa  396  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  51.01 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  47.36 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  48.62 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  49.87 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  47.98 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  48.01 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  47.63 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  47.88 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  46.98 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  49.87 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  45.71 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  49.37 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  47.37 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  44.95 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  46.85 
 
 		 395 aa  358  9e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  48.49 
 
 		 389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  46.63 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  44.44 
 
 		 392 aa  349  5e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  43.58 
 
 		 395 aa  348  9e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  47.86 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  46.6 
 
 		 389 aa  347  3e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  46.12 
 
 		 390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  44.19 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  41.54 
 
 		 403 aa  315  6e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  41.06 
 
 		 399 aa  315  7e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  40.55 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  40.81 
 
 		 395 aa  308  9e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  41.65 
 
 		 400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  40.55 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  36.18 
 
 		 412 aa  202  6e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  33.5 
 
 		 413 aa  196  5.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  31.05 
 
 		 271 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0390  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.55 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.997224  normal  0.0213751 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.85 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1739  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.1 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00258583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  27.27 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.61 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.64 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13021  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.18 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.98106  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.78 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1605  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.33 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0458572  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37067  predicted protein  28.47 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.5 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.92 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0946  GTP-binding protein YchF  27.23 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.5 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.35 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.909233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.73 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.54 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0677  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.29 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.27 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0206  GTP-binding protein YchF  27.18 
 
 		 357 aa  100  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.43 
 
 		 362 aa  100  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.27 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0099  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.83 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3631  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.92 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3733  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.34 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1318  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.19 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0104464  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.38 
 
 		 360 aa  99.4  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61820  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.59 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000490412  hitchhiker  0.00796401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.75 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1105  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.79 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.692178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1796  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.05 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.3 
 
 		 365 aa  98.6  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  26.57 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0386  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.75 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5323  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.36 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1047  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.72 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0977  GTP-binding protein YchF  41.55 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.245774  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.36 
 
 		 357 aa  97.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.85 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0154  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.78 
 
 		 362 aa  97.4  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.1 
 
 		 367 aa  97.1  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13271  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.89 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1052  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.19 
 
 		 366 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.133345 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13131  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.56 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0648  GTP-binding protein YchF  26.51 
 
 		 362 aa  97.1  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.379901 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0117  GTPase, translation factor  25.71 
 
 		 367 aa  97.1  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.6 
 
 		 367 aa  96.7  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3679  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.13 
 
 		 364 aa  96.7  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104752  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4776  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.55 
 
 		 366 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117268  hitchhiker  0.000704522 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2219  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.75 
 
 		 365 aa  96.7  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4756  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.75 
 
 		 366 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.586629  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2831  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.76 
 
 		 368 aa  96.3  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  27.88 
 
 		 367 aa  96.3  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0517  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.12 
 
 		 362 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1280  GTP-binding protein YchF  28.87 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09848  putative ATP/GTP-binding protein  26.94 
 
 		 364 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0700  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.52 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08711  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.07 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1166  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.63 
 
 		 367 aa  95.5  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.219155  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2204  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.86 
 
 		 363 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000173002  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0101  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.68 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.720243  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2546  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.52 
 
 		 363 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000002151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04539  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.26 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.910533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>