More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0065 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  47.34 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  38.79 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  36.56 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  39.04 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  38.36 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  31.12 
 
 		 202 aa  87.8  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  27.89 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  30.77 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  29.41 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  27.81 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  29.95 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  27.27 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  29.35 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  30.69 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  29.63 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  27.96 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  29.79 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53410  predicted protein  24.88 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  32.28 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  33.13 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2106  methylase  27.78 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0682374  normal  0.0494435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  29.38 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  34.21 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4295  methylase  33.7 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  33.04 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  34.78 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  25.9 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0945  hypothetical protein  28.99 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  40 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.42 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.96 
 
 		 312 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  32.43 
 
 		 284 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  27.27 
 
 		 288 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0847  methyltransferase small  27.19 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.06 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  31.3 
 
 		 284 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.47 
 
 		 333 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0021  protein of unknown function Met10  26.21 
 
 		 328 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1380  putative methylase  23.91 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.26 
 
 		 312 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  35.79 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.92 
 
 		 312 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  28.04 
 
 		 382 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0875  putative methylase  27.17 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  35.34 
 
 		 414 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0745  HemK family modification methylase  28.16 
 
 		 271 aa  52.4  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.150019  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.06 
 
 		 298 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.66 
 
 		 312 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.66 
 
 		 312 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.66 
 
 		 312 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.66 
 
 		 312 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.66 
 
 		 312 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  29.68 
 
 		 288 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 		 312 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.17 
 
 		 300 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.17 
 
 		 300 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 		 312 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0349  ribosomal L11 methyltransferase  40 
 
 		 336 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.500973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1284  HemK family modification methylase  27.59 
 
 		 271 aa  51.2  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  26.67 
 
 		 231 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.06 
 
 		 298 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 315 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 		 312 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1069  methyltransferase small  38.36 
 
 		 260 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0704702  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17444  predicted protein  27.86 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.530661  normal  0.176894 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02104  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.563309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  24.06 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5532  predicted protein  26.74 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  29.46 
 
 		 317 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  27.51 
 
 		 382 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  30.43 
 
 		 322 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.16 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  21.16 
 
 		 280 aa  49.7  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  29.32 
 
 		 271 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  30.77 
 
 		 288 aa  49.7  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  30 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  22.46 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  29.82 
 
 		 287 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1852  ribosomal L11 methyltransferase  39.73 
 
 		 282 aa  49.3  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.524439  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  30.77 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.17 
 
 		 300 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  26.67 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1247  methylase of polypeptide chain release factor  23.84 
 
 		 280 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  27.27 
 
 		 317 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.17 
 
 		 300 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.17 
 
 		 300 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  26.67 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 		 321 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  34.82 
 
 		 307 aa  48.9  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  31.25 
 
 		 494 aa  48.9  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  28.74 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0859  hypothetical protein  37.11 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.27 
 
 		 297 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.16 
 
 		 312 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  27.52 
 
 		 386 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.28 
 
 		 300 aa  48.5  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  28.57 
 
 		 246 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>