34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0061 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0061  50S ribosomal protein L21e  100 
 
 
99 aa  194  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.257868  normal  0.16503 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1808  Ribosomal protein L21e  74.47 
 
 
101 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1748  50S ribosomal protein L21e  50.51 
 
 
100 aa  105  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00441406  hitchhiker  0.00234817 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0578  50S ribosomal protein L21e  55.32 
 
 
100 aa  103  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00254948 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1729  50S ribosomal protein L21e  53.19 
 
 
99 aa  101  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.74633 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1568  50S ribosomal protein L21e  51.06 
 
 
100 aa  96.7  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0355  50S ribosomal protein L21e  46.88 
 
 
102 aa  83.6  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0765  Ribosomal protein L21e  43.3 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1874  50S ribosomal protein L21e  41.76 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1583  50S ribosomal protein L21e  42.55 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.857138  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0854  50S ribosomal protein L21e  41.49 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0214236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1092  50S ribosomal protein L21e  41.49 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343816  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1568  50S ribosomal protein L21e  40.43 
 
 
98 aa  77  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0148926 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1105  50S ribosomal protein L21e  41.49 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0993  50S ribosomal protein L21e  44.44 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1961  50S ribosomal protein L21e  39.56 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.613539  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1954  ribosomal protein L21e  39.39 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0057  50S ribosomal protein L21e  40.43 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.280466  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0547  50S ribosomal protein L21e  40.66 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.017602  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3026  50S ribosomal protein L21e  39.77 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0905  50S ribosomal protein L21e  42.22 
 
 
97 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000341646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3231  50S ribosomal protein L21e  38.46 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000418064  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2277  50S ribosomal protein L21e  37.36 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.644218  normal  0.149575 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1098  Ribosomal protein L21e  38.89 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232936  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2674  Ribosomal protein L21e  39.76 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.395884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2388  Ribosomal protein L21e  38.46 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0624  50S ribosomal protein L21e  35.56 
 
 
98 aa  62  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535137  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1384  50S ribosomal protein L21e  38.46 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02170  60s ribosomal protein l21-a, putative  40 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.771683  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46735  predicted protein  35.94 
 
 
163 aa  47.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27810  Ribosomal protein L21, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.33 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.186953 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46510  predicted protein  32.81 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04802  60S ribosomal protein L21, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06960)  32.81 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67316  predicted protein  33.33 
 
 
160 aa  40.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>