More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0054 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.11 
 
 
913 aa  987    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
905 aa  1833    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.74 
 
 
916 aa  499  1e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.48 
 
 
932 aa  486  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.22 
 
 
916 aa  481  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.98 
 
 
927 aa  479  1e-133  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.26 
 
 
926 aa  474  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  33.44 
 
 
939 aa  474  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.55 
 
 
915 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.67 
 
 
912 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  34.91 
 
 
955 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.58 
 
 
944 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  33.16 
 
 
946 aa  468  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.18 
 
 
897 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  32.2 
 
 
943 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.94 
 
 
928 aa  460  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.69 
 
 
928 aa  457  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 
946 aa  456  1e-127  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  33.86 
 
 
954 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.51 
 
 
937 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.77 
 
 
972 aa  450  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  32.42 
 
 
903 aa  450  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  33.08 
 
 
898 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.39 
 
 
903 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.46 
 
 
890 aa  440  9.999999999999999e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.22 
 
 
909 aa  427  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.64 
 
 
970 aa  411  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.89 
 
 
913 aa  410  1e-113  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  33.84 
 
 
1688 aa  291  5.0000000000000004e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  29.64 
 
 
875 aa  279  2e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  32.71 
 
 
1506 aa  272  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  31.57 
 
 
1480 aa  271  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  30.41 
 
 
873 aa  271  5e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.71 
 
 
1476 aa  270  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  32.94 
 
 
888 aa  267  8e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.19 
 
 
931 aa  265  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  28.81 
 
 
870 aa  264  6.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  29.84 
 
 
1584 aa  261  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  31.43 
 
 
1535 aa  259  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.9 
 
 
874 aa  253  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  28.09 
 
 
874 aa  249  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.49 
 
 
933 aa  248  3e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  31.9 
 
 
1536 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  31.95 
 
 
1536 aa  247  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.95 
 
 
1497 aa  247  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  27.82 
 
 
874 aa  247  9e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  31.01 
 
 
1495 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.78 
 
 
824 aa  246  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  31.74 
 
 
1536 aa  246  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.7 
 
 
1553 aa  246  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.52 
 
 
1412 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  29.89 
 
 
1567 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  32.84 
 
 
1448 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  30.21 
 
 
872 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  33.04 
 
 
1573 aa  243  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  28.05 
 
 
1388 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.02 
 
 
1523 aa  243  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  31.16 
 
 
1504 aa  242  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  31.24 
 
 
1523 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.24 
 
 
1523 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  32.54 
 
 
1448 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  30.38 
 
 
1534 aa  240  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  29.07 
 
 
1549 aa  239  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.61 
 
 
1534 aa  239  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  31.03 
 
 
915 aa  239  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  29.53 
 
 
1618 aa  238  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.99 
 
 
1429 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  32.43 
 
 
1531 aa  238  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  29.27 
 
 
1544 aa  236  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  31.37 
 
 
1431 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  27.59 
 
 
872 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.87 
 
 
1510 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.39 
 
 
1539 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  32.63 
 
 
1435 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.45 
 
 
1517 aa  235  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  29.87 
 
 
1572 aa  234  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.03 
 
 
1516 aa  234  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.31 
 
 
884 aa  233  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  30.22 
 
 
1493 aa  233  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.62 
 
 
1620 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.05 
 
 
1426 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.73 
 
 
1514 aa  232  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  31.53 
 
 
1513 aa  232  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  29.89 
 
 
1434 aa  231  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.62 
 
 
1561 aa  230  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  28.05 
 
 
1419 aa  230  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.82 
 
 
1480 aa  230  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.16 
 
 
1505 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  30.18 
 
 
1509 aa  229  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  29.51 
 
 
914 aa  229  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  33.16 
 
 
1515 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  29.34 
 
 
1606 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.18 
 
 
806 aa  228  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.95 
 
 
900 aa  228  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.72 
 
 
1538 aa  228  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.98 
 
 
1508 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.52 
 
 
1518 aa  227  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.14 
 
 
1475 aa  227  9e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  28.57 
 
 
807 aa  226  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.23 
 
 
846 aa  227  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.593625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>