214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0037 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  100 
 
 		 143 aa  285  1e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  71.13 
 
 		 143 aa  222  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  51.75 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  50.35 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  50.35 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  48.95 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  43.66 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  46.81 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  46.81 
 
 		 148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  45.59 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  40.43 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  40.43 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  45 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  43.07 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  36.62 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  40.15 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  38.46 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  37.32 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  35.92 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  35.92 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  36.43 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  39.85 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  36.69 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  37.69 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  32.14 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  32.85 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  36.09 
 
 		 184 aa  88.6  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  30.66 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  35.04 
 
 		 173 aa  83.6  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  35.04 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  35.04 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  34.31 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  30.28 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  27.78 
 
 		 166 aa  70.1  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  36.11 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0830  transcription elongation factor NusA  31.63 
 
 		 482 aa  54.7  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0231544  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  34.31 
 
 		 344 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0597  NusA antitermination factor  37.76 
 
 		 425 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  31.68 
 
 		 393 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  34.31 
 
 		 344 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1870  transcription elongation factor NusA  36.73 
 
 		 425 aa  53.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0338144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  34.78 
 
 		 351 aa  52  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1214  NusA antitermination factor  33.67 
 
 		 414 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16961  transcription elongation factor NusA  33.67 
 
 		 467 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0339666  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3978  transcription elongation factor NusA  35.71 
 
 		 426 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0033  transcription elongation factor NusA  36.36 
 
 		 413 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122242  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  33 
 
 		 463 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  32.67 
 
 		 413 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  34.83 
 
 		 392 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  34.69 
 
 		 485 aa  50.1  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  34.95 
 
 		 441 aa  50.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  35.11 
 
 		 337 aa  50.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  32.98 
 
 		 344 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2079  transcription elongation factor NusA  34.69 
 
 		 481 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.376983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1627  transcription elongation factor NusA  32.2 
 
 		 322 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0884036  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1234  transcription elongation factor NusA  35.23 
 
 		 395 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000227935  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  34.69 
 
 		 471 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  34.69 
 
 		 484 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  31.52 
 
 		 331 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  32.65 
 
 		 467 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  31.52 
 
 		 333 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  31.91 
 
 		 327 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  31.91 
 
 		 324 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  33.67 
 
 		 369 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1107  transcription elongation factor NusA  31.63 
 
 		 495 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  34.69 
 
 		 497 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0138  transcription elongation factor NusA  29.52 
 
 		 411 aa  48.1  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  34.69 
 
 		 497 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0735  transcription elongation factor NusA  34.31 
 
 		 344 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000302084  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  32.65 
 
 		 423 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0383  NusA antitermination factor  32.32 
 
 		 498 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.66797  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1412  transcription elongation factor NusA  30.61 
 
 		 344 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000474551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  31.52 
 
 		 346 aa  47.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  30.85 
 
 		 329 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  30.3 
 
 		 534 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  34 
 
 		 442 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  33.66 
 
 		 442 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 347 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 347 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 347 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  32.67 
 
 		 341 aa  47  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0254  transcription elongation factor NusA  28.41 
 
 		 444 aa  47  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1094  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 493 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  31.52 
 
 		 339 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  30.85 
 
 		 362 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16721  transcription elongation factor NusA  35.23 
 
 		 467 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  30.85 
 
 		 337 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1228  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 493 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00625796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  32.65 
 
 		 380 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  33.67 
 
 		 412 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  30.39 
 
 		 401 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  30.43 
 
 		 357 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  32.65 
 
 		 468 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3421  transcription elongation factor NusA  26.53 
 
 		 418 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01340  transcription elongation factor NusA  31.63 
 
 		 410 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  30.53 
 
 		 366 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  30.43 
 
 		 348 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  36.36 
 
 		 357 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  33.67 
 
 		 412 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1368  transcription elongation factor NusA  30.85 
 
 		 347 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219498  normal  0.327685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>