297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0019 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0019  AIR synthase-like protein  100 
 
 		 313 aa  637    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.213041  decreased coverage  0.00139533 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1216  AIR synthase related protein  35.49 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0540136  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1646  thiamine monophosphate kinase-like protein  31.1 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  29.07 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  28.57 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  26.05 
 
 		 327 aa  89.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.02 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  25.08 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0170  thiamine monophosphate kinase-like protein  25.55 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  29.89 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  27.59 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  28.17 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  29.91 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  28.36 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  28.36 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  28.08 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  25.62 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  28.36 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  28.41 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  27.84 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  31.05 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  28.36 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  27.47 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  24.68 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  26.64 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  27.68 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  27.47 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1202  thiamine monophosphate kinase-like protein  24.84 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  29.17 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  25.36 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  24.12 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  23.51 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  26.67 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0657  thiamine monophosphate kinase-like protein  24.5 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  25.75 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  30.58 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  28.15 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  28.57 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  27.76 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  24.52 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1448  thiamine-monophosphate kinase  24.21 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  29.3 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0476  thiamine-phosphate kinase  25.47 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  28.03 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  28.1 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  27.94 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  25.72 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  27.4 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  27.7 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  28.46 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  29.44 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  28.06 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  26.39 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  25.9 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  26.64 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  24.18 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  24.7 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  28.4 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  26.49 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  27.99 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0185  thiamine monophosphate kinase-like protein  26.34 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  26.79 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  26.1 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  28.34 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  27.76 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  27.06 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  25.71 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  28.79 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  27.17 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  27.76 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  28.62 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  28.62 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  28.62 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  28.62 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  28.62 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  25.54 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  29.08 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  26.16 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  29.08 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  25.54 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1047  thiamine-monophosphate kinase  24.28 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061049 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0928  thiamine-monophosphate kinase  24.28 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  27.96 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  26.25 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  26.38 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  25.76 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  25.46 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  25.52 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  27.94 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  28.22 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  25.85 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  28.67 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  24.91 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  29.39 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0413  AIR synthase related protein  24.69 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  27.44 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  28.67 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  28.67 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>