More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0015 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 337 aa  674    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  66.07 
 
 		 335 aa  462  1e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  60.24 
 
 		 336 aa  414  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  56.29 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  54.63 
 
 		 332 aa  373  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  54.49 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  52.4 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  50.15 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  46.25 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  45.65 
 
 		 337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  45.51 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  44.01 
 
 		 338 aa  277  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  44.28 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  41.74 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  43.92 
 
 		 338 aa  262  6.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 		 346 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  39.27 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  40.48 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  38.55 
 
 		 337 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  38.38 
 
 		 550 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0610  Adenylosuccinate synthase  36.72 
 
 		 507 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278665  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2004  adenylosuccinate synthase  31.52 
 
 		 561 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00819563  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  31.89 
 
 		 423 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  30.95 
 
 		 435 aa  162  9e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  29.38 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  29.55 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0677  adenylosuccinate synthetase  29.29 
 
 		 429 aa  159  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  30.26 
 
 		 430 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  30.48 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  29.08 
 
 		 432 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  29.31 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  29.44 
 
 		 431 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  29.31 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  29.52 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  30.42 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  29.31 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  28.91 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  29.52 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  29.31 
 
 		 432 aa  155  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  29.21 
 
 		 431 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  28.84 
 
 		 432 aa  156  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  29.31 
 
 		 432 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  30.48 
 
 		 432 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  30.97 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  29.25 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  29.25 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0403  adenylosuccinate synthetase  29.02 
 
 		 424 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  29.74 
 
 		 438 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1784  adenylosuccinate synthetase  29.61 
 
 		 416 aa  152  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0153593  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  32.73 
 
 		 444 aa  152  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  29.76 
 
 		 431 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2131  adenylosuccinate synthetase  27.91 
 
 		 416 aa  151  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  28.23 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  29.25 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  27.9 
 
 		 430 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  29.38 
 
 		 431 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  28.91 
 
 		 432 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  27.66 
 
 		 432 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  29.51 
 
 		 438 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  29.29 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  28.16 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  28.37 
 
 		 445 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  28.09 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  28.67 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  29.27 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  30.21 
 
 		 427 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  31.33 
 
 		 447 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  28.2 
 
 		 429 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1409  adenylosuccinate synthetase  29.7 
 
 		 448 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000087591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  31.33 
 
 		 447 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  27.05 
 
 		 416 aa  149  8e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  31.33 
 
 		 447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  27.75 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  28.47 
 
 		 437 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  31.34 
 
 		 449 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  28.37 
 
 		 431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  27.91 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  29.15 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  28.27 
 
 		 434 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  28.91 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  32.74 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  29.83 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0368  adenylosuccinate synthetase  29.23 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.361154  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  29.93 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  27.66 
 
 		 430 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  29.38 
 
 		 431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  27.66 
 
 		 430 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>