111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0013 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
321 aa  655    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  53.09 
 
 
327 aa  373  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
323 aa  212  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 
323 aa  209  6e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  36.86 
 
 
332 aa  209  7e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  36.86 
 
 
322 aa  203  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
321 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.45 
 
 
337 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
328 aa  116  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  27.16 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.21 
 
 
337 aa  104  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  28.39 
 
 
322 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.1 
 
 
349 aa  96.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  24.74 
 
 
351 aa  96.3  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.86 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.44 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.48 
 
 
361 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  24.44 
 
 
353 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  23.95 
 
 
363 aa  92.8  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.74 
 
 
359 aa  92.8  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  23.75 
 
 
348 aa  92.4  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  25.78 
 
 
330 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  23.29 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  23.75 
 
 
348 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.1 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  24.67 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  23.75 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  22.85 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.4 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.68 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.52 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  23.78 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  24.56 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
157 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
150 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  21.28 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.83 
 
 
159 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
157 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
159 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  23.47 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 
149 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 
153 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
152 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
159 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
162 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
151 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 
155 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
155 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  22.19 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.67 
 
 
152 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.69 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.44 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
160 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3175  nitrite reductase heme biosynthesis G  30.77 
 
 
149 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
164 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
158 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
156 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 
161 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
176 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
161 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
182 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.69 
 
 
165 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.83 
 
 
165 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
166 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  29.23 
 
 
154 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2611  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.25 
 
 
167 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.672357  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  21.36 
 
 
385 aa  59.7  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 
166 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
158 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  24.66 
 
 
160 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  23.53 
 
 
156 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
160 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.65 
 
 
160 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  30.17 
 
 
174 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  30.48 
 
 
178 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1446  AsnC family transcriptional regulator  28.44 
 
 
163 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.855842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 
156 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  24.8 
 
 
170 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  22.67 
 
 
170 aa  56.6  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  27.36 
 
 
174 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  25.85 
 
 
160 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  20.78 
 
 
769 aa  56.2  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2492  AsnC family transcriptional regulator  28.46 
 
 
157 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
162 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  27.48 
 
 
160 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.43 
 
 
160 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3268  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
152 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.573654  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  32.08 
 
 
171 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  26.55 
 
 
160 aa  53.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  29.46 
 
 
166 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  31.13 
 
 
171 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0542  hypothetical protein  24.42 
 
 
373 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.379278 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  26.42 
 
 
183 aa  50.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  26.17 
 
 
164 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>