More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0005 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0005  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1477 bp  2928  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  1.46782e-05  normal  0.725323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0012  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1477 bp  2928  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.579936  normal  0.0913592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0001  16S ribosomal RNA  89.55 
 
 
1481 bp  1677  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  1.52569e-05  normal  0.236967 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0053  16S ribosomal RNA  89.55 
 
 
1481 bp  1677  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.497813  normal  0.0940245 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0011  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 
1542 bp  579  1e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0038  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 
1542 bp  579  1e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106997  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0012  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 
1545 bp  579  1e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0039  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 
1545 bp  579  1e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0039  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 
1550 bp  579  1e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0012  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 
1550 bp  579  1e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0021  16S ribosomal RNA  83.5 
 
 
1551 bp  569  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.184479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0005  16S ribosomal RNA  83.5 
 
 
1551 bp  569  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.872751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0058  16S ribosomal RNA  83.49 
 
 
1543 bp  559  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 
1548 bp  561  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.12216e-11  hitchhiker  1.95391e-07 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0063  16S ribosomal RNA  83.49 
 
 
1543 bp  559  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0073  16S ribosomal RNA  83.49 
 
 
1543 bp  559  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 
1548 bp  561  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.53041e-11  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0018  16S ribosomal RNA  83.49 
 
 
1543 bp  559  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 
1551 bp  561  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  8.68141e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0064  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 
1551 bp  561  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.06886e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 
1551 bp  561  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.68462e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 
1551 bp  561  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.675e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  83.64 
 
 
1563 bp  543  1e-152  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.8279e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  83.64 
 
 
1563 bp  543  1e-152  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 
1548 bp  543  1e-152  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 
1548 bp  543  1e-152  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 
1548 bp  543  1e-152  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 
1548 bp  543  1e-152  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  83.06 
 
 
1548 bp  537  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0010  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 
1491 bp  537  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  2.16125e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0028  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 
1491 bp  537  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0022269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  83.06 
 
 
1548 bp  537  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0060  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 
1493 bp  525  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00434278  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0013  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 
1493 bp  525  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  1.16367e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_R0067  16S ribosomal RNA  85.3 
 
 
1493 bp  517  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0037685  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0002  16S ribosomal RNA  85.3 
 
 
1493 bp  517  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.398256  normal  0.523435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0043  16S ribosomal RNA  83.98 
 
 
1550 bp  507  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0032  16S ribosomal RNA  83.98 
 
 
1550 bp  507  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0577345 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 
1544 bp  502  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 
1544 bp  502  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.27714e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 
1544 bp  502  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  85.46 
 
 
1545 bp  498  1e-138  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  85.46 
 
 
1545 bp  498  1e-138  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  85.46 
 
 
1545 bp  498  1e-138  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 
1546 bp  494  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  85.31 
 
 
1546 bp  490  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 
1545 bp  482  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 
1545 bp  482  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  81.66 
 
 
1535 bp  470  1e-130  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  81.66 
 
 
1535 bp  470  1e-130  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  5.14214e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5753  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1509 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5750  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1508 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0068  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0090  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1562 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5744  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1508 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5756  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1508 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5759  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1509 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5762  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1509 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5765  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1508 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0443196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0341  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1509 bp  438  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0071  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00175837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0059  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  8.11926e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0054  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00288313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0062  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1510 bp  438  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5747  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1509 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5741  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1508 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5738  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1508 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0065  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 
1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5768  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1508 bp  434  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.642383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5685  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1508 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.17628e-15 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5019  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.03826  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5687  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1508 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.01452e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5690  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5038  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.28353e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5152  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000400545  hitchhiker  0.00430273 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0142  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1544 bp  430  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  9.78777e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1510 bp  430  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4781  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00045189  hitchhiker  3.13025e-07 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0007  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0031  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1508 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.47217e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5703  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5675  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5673  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1508 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.77172e-11 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5671  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0932e-12 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5664  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5722  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0170559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5822  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.446882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0208  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.98584e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4582  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00856308  normal  0.0343893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4991  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167942  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4997  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.544547  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5007  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5013  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 
1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1518  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>