More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0005 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0005  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1477 bp  2928    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000146782  normal  0.725323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0001  16S ribosomal RNA  89.55 
 
 		 1481 bp  1677    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000152569  normal  0.236967 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0012  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1477 bp  2928    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.579936  normal  0.0913592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0053  16S ribosomal RNA  89.55 
 
 		 1481 bp  1677    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.497813  normal  0.0940245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0039  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 		 1545 bp  579  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0012  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 		 1545 bp  579  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0012  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 		 1550 bp  579  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0039  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 		 1550 bp  579  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0011  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 		 1542 bp  579  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0038  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 		 1542 bp  579  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0021  16S ribosomal RNA  83.5 
 
 		 1551 bp  569  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.184479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0005  16S ribosomal RNA  83.5 
 
 		 1551 bp  569  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.872751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 		 1551 bp  561  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 		 1551 bp  561  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 		 1551 bp  561  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0064  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 		 1551 bp  561  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000106886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0063  16S ribosomal RNA  83.49 
 
 		 1543 bp  559  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0058  16S ribosomal RNA  83.49 
 
 		 1543 bp  559  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0073  16S ribosomal RNA  83.49 
 
 		 1543 bp  559  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 		 1548 bp  561  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 		 1548 bp  561  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0018  16S ribosomal RNA  83.49 
 
 		 1543 bp  559  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1548 bp  543  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1548 bp  543  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1548 bp  543  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1548 bp  543  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 1563 bp  543  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 1563 bp  543  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  83.06 
 
 		 1548 bp  537  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  83.06 
 
 		 1548 bp  537  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0010  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 		 1491 bp  537  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000216125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0028  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 		 1491 bp  537  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0022269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0013  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1493 bp  525  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000116367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0060  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1493 bp  525  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00434278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_R0067  16S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 1493 bp  517  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0037685  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0002  16S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 1493 bp  517  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.398256  normal  0.523435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0032  16S ribosomal RNA  83.98 
 
 		 1550 bp  507  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0577345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0043  16S ribosomal RNA  83.98 
 
 		 1550 bp  507  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1544 bp  502  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1544 bp  502  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1544 bp  502  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  85.46 
 
 		 1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  85.46 
 
 		 1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  85.46 
 
 		 1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 		 1546 bp  494  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 1546 bp  490  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1545 bp  482  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1545 bp  482  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  81.66 
 
 		 1535 bp  470  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  81.66 
 
 		 1535 bp  470  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0071  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00175837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0068  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5738  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1508 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5741  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1508 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5744  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1508 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5747  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1509 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5750  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1508 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5753  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1509 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5756  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1508 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5759  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1509 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5762  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1509 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5765  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1508 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0443196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1562 bp  438  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0090  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0341  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1509 bp  438  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1510 bp  438  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0054  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00288313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000811926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0059  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0062  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0065  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1544 bp  438  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5768  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1508 bp  434  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.642383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-1  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1510 bp  430  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0007  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1509 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-11  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1510 bp  430  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-2  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1510 bp  430  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0330  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1508 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00177691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-4  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1510 bp  430  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.823998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0324  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1508 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000098756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0184  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1508 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000878132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-8  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1510 bp  430  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1509 bp  430  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1510 bp  430  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1503 bp  430  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1510 bp  430  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1503 bp  430  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1510 bp  430  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0475549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1503 bp  430  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1503 bp  430  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1510 bp  430  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0031  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1508 bp  430  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000247217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1510 bp  430  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.153942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1510 bp  430  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 1510 bp  430  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  81.45 
 
 		 1530 bp  430  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  81.45 
 
 		 1689 bp  430  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>