299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0004 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0004  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0010  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0012  tRNA-Glu  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0022  tRNA-Glu  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000000692994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0060  tRNA-Glu  91.78 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t37  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628629  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0062  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.427189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0043  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000374465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0044  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000772538  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0041  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0045  tRNA-Glu  94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0333401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0021  tRNA-Glu  89.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.228053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0005  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334016 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0040  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0111833  normal  0.897569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0006  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0014  tRNA-Glu  95.35 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0083  tRNA-Glu  92 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0032  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519477  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t24  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t25  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0571109  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0009  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0033  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.150537  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0011  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.406571 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0077  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00689087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0043  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0177795  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0036  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000509558  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0075  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000263239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0046  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113543  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0105  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00614062  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0109  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000218236  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0083  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000720512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0041  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00117602  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0045  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0637715  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0010  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.644532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0030  tRNA-Glu  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0002  tRNA-Glu  90 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9841800000000004e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0004  tRNA-Glu  90 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.0060400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0011  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.267714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0041  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0024  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0007  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183145  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0113  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000136278  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0079  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0078  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000635495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0112  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000133655  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01850  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0026  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.062518  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0026  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.307498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0104  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0156595  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0106  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00248374  normal  0.1959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0107  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000800157  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGluVIMSS1309151  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0730688  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0080  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0110  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000208441  normal  0.204301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0111  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000137608  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0108  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0072  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000259101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0074  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000046104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0077  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0076  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0073  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000527545  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0082  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0081  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000920417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0084  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000679544  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGluVIMSS1309378  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0037  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000218875  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0038  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000255678  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0040  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115197  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0042  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353157  normal  0.196649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0039  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037327  normal  0.202032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0044  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369113  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGluVIMSS1309075  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGluVIMSS1309126  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGluVIMSS1309208  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.689492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGluVIMSS1309264  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0008  tRNA-Glu  84.93 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.862218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0052  tRNA-Glu  91.11 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0034  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0629823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0031  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0040985  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0018  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000034168  normal  0.183849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0043  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000194529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0032  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.449659  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0031  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0063  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0033  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000100109  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0017  tRNA-Glu  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>