More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3029 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  72.05 
 
 
555 aa  815  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  100 
 
 
556 aa  1137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  46.87 
 
 
559 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  46.51 
 
 
559 aa  487  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  46.69 
 
 
559 aa  488  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  46.51 
 
 
559 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  45.17 
 
 
561 aa  488  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  46.51 
 
 
559 aa  487  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  46.51 
 
 
559 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  46.03 
 
 
565 aa  470  1e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  40 
 
 
584 aa  465  1e-130  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  44.82 
 
 
568 aa  449  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  39.42 
 
 
596 aa  446  1e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  44.33 
 
 
589 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  41.33 
 
 
586 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  40.28 
 
 
585 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  43.47 
 
 
577 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  42.2 
 
 
587 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  42.93 
 
 
598 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  41.99 
 
 
578 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  40.95 
 
 
581 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  41.99 
 
 
578 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  41.99 
 
 
578 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  39.65 
 
 
591 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  40.72 
 
 
544 aa  415  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  34.73 
 
 
583 aa  362  7e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  36.06 
 
 
589 aa  361  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  36.24 
 
 
583 aa  360  5e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  35.37 
 
 
586 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  35.25 
 
 
586 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  35.8 
 
 
586 aa  340  4e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  36.64 
 
 
575 aa  340  5e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  37.45 
 
 
578 aa  334  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  38.98 
 
 
575 aa  333  4e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  35.62 
 
 
491 aa  212  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  31.02 
 
 
493 aa  186  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  31.3 
 
 
492 aa  185  2e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  31.09 
 
 
492 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  31.09 
 
 
492 aa  182  9e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  31.09 
 
 
492 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  29.19 
 
 
485 aa  182  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  30.79 
 
 
494 aa  180  5e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  3.50237e-05 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  28.87 
 
 
483 aa  180  7e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  30.18 
 
 
482 aa  179  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  30.97 
 
 
498 aa  178  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  28.57 
 
 
489 aa  177  5e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  30.57 
 
 
494 aa  176  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18626e-09 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  30.57 
 
 
494 aa  176  1e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  7.22293e-08 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  29.03 
 
 
644 aa  169  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  27.74 
 
 
492 aa  166  2e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  27.49 
 
 
636 aa  165  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  28.6 
 
 
493 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  28.54 
 
 
651 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  26.94 
 
 
650 aa  161  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  28.57 
 
 
508 aa  157  5e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  27.75 
 
 
663 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  28.74 
 
 
639 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  25.71 
 
 
534 aa  151  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  26.71 
 
 
643 aa  149  1e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  27.95 
 
 
650 aa  149  2e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  24.65 
 
 
649 aa  149  2e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  25.77 
 
 
650 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  28.52 
 
 
645 aa  147  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 
641 aa  142  2e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  26.91 
 
 
652 aa  142  2e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  3.23164e-05 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  27.22 
 
 
548 aa  142  2e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  25.84 
 
 
646 aa  138  3e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  24.96 
 
 
645 aa  136  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  26.67 
 
 
651 aa  134  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.26302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  27.15 
 
 
638 aa  133  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  26 
 
 
1093 aa  132  1e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  30.48 
 
 
1092 aa  130  5e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  24.22 
 
 
650 aa  129  1e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  23.57 
 
 
1088 aa  128  2e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  23.68 
 
 
667 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  25.11 
 
 
551 aa  128  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  24.47 
 
 
1119 aa  126  8e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  28.99 
 
 
1123 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  25.56 
 
 
1093 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  25.05 
 
 
661 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  26.32 
 
 
610 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  26.8 
 
 
672 aa  126  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  31.2 
 
 
553 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  25.89 
 
 
567 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  28.9 
 
 
1108 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  24.14 
 
 
1088 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  30.48 
 
 
1088 aa  124  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  30.48 
 
 
1088 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  27.29 
 
 
642 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  24.62 
 
 
1100 aa  124  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  24.61 
 
 
1116 aa  124  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  25.74 
 
 
1121 aa  123  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  29.15 
 
 
1088 aa  123  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  23.7 
 
 
1116 aa  122  1e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  23.66 
 
 
1085 aa  122  1e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  24.17 
 
 
1108 aa  122  1e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  30.63 
 
 
556 aa  122  2e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  25 
 
 
1061 aa  122  2e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  30.22 
 
 
1152 aa  122  2e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  30.18 
 
 
572 aa  122  2e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>