239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3023 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 408 aa  798    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  44.44 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  34.21 
 
 		 416 aa  176  8e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  37.41 
 
 		 932 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  33.45 
 
 		 919 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  33.79 
 
 		 946 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  25.16 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  25.16 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  26.47 
 
 		 468 aa  89  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  27.41 
 
 		 330 aa  87.4  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  24.4 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  24.76 
 
 		 694 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  20.43 
 
 		 1036 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  30.36 
 
 		 673 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  25.81 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  25.14 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0534  S-layer domain-containing protein  28.33 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00470893  normal  0.0913053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  27.91 
 
 		 784 aa  67  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  26.34 
 
 		 343 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  23.42 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  36.47 
 
 		 859 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  36.47 
 
 		 862 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  49.09 
 
 		 935 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0519  S-layer domain protein  30 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28861  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  36.47 
 
 		 862 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  22.01 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  35.29 
 
 		 861 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0057  S-layer domain-containing protein  28.46 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  44.62 
 
 		 536 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  38.68 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  38.68 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  38.32 
 
 		 658 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  38.68 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  36.67 
 
 		 500 aa  57  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  37.74 
 
 		 528 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  38.32 
 
 		 629 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  38.68 
 
 		 524 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  37.74 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  40.26 
 
 		 575 aa  56.6  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.78 
 
 		 688 aa  56.2  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  37.74 
 
 		 475 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1926  S-layer protein  38.37 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000888894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  36.45 
 
 		 622 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1787  S-layer protein  38.37 
 
 		 344 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174638  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1744  S-layer protein  37.21 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000139139  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  37.74 
 
 		 561 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1962  putative S-layer protein  38.37 
 
 		 331 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000041962 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  32.04 
 
 		 485 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0715  S-layer domain-containing protein  34.12 
 
 		 879 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  37.29 
 
 		 578 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  36.45 
 
 		 643 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  34.68 
 
 		 531 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  45.31 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  36.84 
 
 		 561 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  35 
 
 		 574 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  36.84 
 
 		 539 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  34.17 
 
 		 533 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  48.89 
 
 		 693 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  41.18 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  40 
 
 		 685 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  32.93 
 
 		 717 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  36.49 
 
 		 461 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  35.25 
 
 		 563 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  35.14 
 
 		 461 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  35.51 
 
 		 604 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  45.83 
 
 		 546 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  42.19 
 
 		 186 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2561  S-layer protein  35.14 
 
 		 189 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0213857  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  43.64 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0975  S-layer protein EA1  32.61 
 
 		 863 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000553738 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  38.94 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  36.9 
 
 		 758 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  51.28 
 
 		 1009 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  31.3 
 
 		 581 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  31.3 
 
 		 581 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  43.14 
 
 		 2313 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2160  S-layer protein  35.53 
 
 		 383 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.028807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  30.43 
 
 		 807 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2315  S-layer protein  35.53 
 
 		 383 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2340  putative S-layer protein  35.53 
 
 		 383 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.1 
 
 		 1016 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  39.22 
 
 		 220 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  39.22 
 
 		 220 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  37.29 
 
 		 669 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  44.9 
 
 		 573 aa  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  35.14 
 
 		 461 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  35.14 
 
 		 461 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  35.44 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  32.82 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  32.69 
 
 		 631 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  44.07 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  39.13 
 
 		 767 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  39.58 
 
 		 225 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3337  S-layer protein  39.22 
 
 		 492 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  27.27 
 
 		 920 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  35.16 
 
 		 544 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  31.3 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  35.14 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  37.93 
 
 		 760 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>