106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3013 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
320 aa  654    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  91.51 
 
 
337 aa  606  9.999999999999999e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  57.61 
 
 
315 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  57.57 
 
 
316 aa  360  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  54.37 
 
 
324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  52.07 
 
 
303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  51.14 
 
 
303 aa  301  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  41.95 
 
 
303 aa  246  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  42.45 
 
 
315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  42.96 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.36 
 
 
303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  42.61 
 
 
323 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  40.07 
 
 
313 aa  241  7.999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.58 
 
 
304 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.83 
 
 
313 aa  239  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.66 
 
 
307 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  41.64 
 
 
342 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.69 
 
 
306 aa  235  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.98 
 
 
330 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  42.96 
 
 
307 aa  232  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.46 
 
 
306 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.42 
 
 
322 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.71 
 
 
307 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.7 
 
 
306 aa  228  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.58 
 
 
320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  41.98 
 
 
314 aa  225  7e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  39.18 
 
 
306 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.01 
 
 
299 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.79 
 
 
305 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  42.24 
 
 
318 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  41.76 
 
 
327 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  39.18 
 
 
306 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  42.16 
 
 
324 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  39.18 
 
 
306 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  40.14 
 
 
305 aa  222  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.79 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.79 
 
 
305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.85 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  38.62 
 
 
305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  38.96 
 
 
306 aa  219  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  39.44 
 
 
305 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  39.44 
 
 
305 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.54 
 
 
306 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  42.32 
 
 
314 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  37.54 
 
 
307 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  40.98 
 
 
307 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.89 
 
 
307 aa  216  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  40.98 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  39.55 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.07 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  41.18 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.48 
 
 
306 aa  210  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  39.85 
 
 
291 aa  209  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.14 
 
 
320 aa  209  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.14 
 
 
320 aa  209  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.53 
 
 
255 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  41.92 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  38.81 
 
 
291 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  36.94 
 
 
291 aa  198  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.34 
 
 
332 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.31 
 
 
277 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.79 
 
 
296 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.71 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.97 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  35.16 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  34.8 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  33.21 
 
 
297 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  32.23 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  34.96 
 
 
297 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  31.25 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  24.66 
 
 
322 aa  63.5  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.83 
 
 
325 aa  62.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  25.93 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.25 
 
 
329 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  40.26 
 
 
130 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.77 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.22 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  25.65 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.8 
 
 
325 aa  60.1  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  24.58 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  25.28 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.68 
 
 
334 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  24.44 
 
 
333 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  26.28 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  25.27 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.4 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  25.27 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.27 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  26.98 
 
 
325 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2447  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 
325 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.43322  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  31.58 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1097  hypothetical cytosolic protein  23.33 
 
 
279 aa  50.4  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  23.23 
 
 
336 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.79 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.56 
 
 
331 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.08 
 
 
329 aa  46.2  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1321  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.31 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00529939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  24.88 
 
 
545 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  26.72 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0751  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.2 
 
 
392 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>