215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3009 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 
308 aa  608  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  83.67 
 
 
304 aa  497  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  55.93 
 
 
312 aa  288  7e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  49.5 
 
 
307 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  48.15 
 
 
314 aa  253  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  48.05 
 
 
312 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  46.65 
 
 
319 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  47.04 
 
 
309 aa  251  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  48.55 
 
 
323 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  47.41 
 
 
320 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  47.06 
 
 
326 aa  247  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  48.73 
 
 
329 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  44.77 
 
 
312 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  48.52 
 
 
318 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  49.17 
 
 
322 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  49.68 
 
 
345 aa  245  8e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  41.86 
 
 
312 aa  244  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  46.24 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  46.86 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  44.36 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  49.41 
 
 
314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  47.08 
 
 
325 aa  242  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  47.88 
 
 
316 aa  242  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  42.68 
 
 
317 aa  242  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  49.01 
 
 
314 aa  242  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  52.74 
 
 
325 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  48.06 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  48.72 
 
 
344 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  48.72 
 
 
344 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  45.93 
 
 
319 aa  236  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  48.84 
 
 
341 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  46.92 
 
 
318 aa  235  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  47.99 
 
 
344 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  44.4 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  49.63 
 
 
356 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  47.88 
 
 
300 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  48.45 
 
 
340 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  44.89 
 
 
357 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  44.59 
 
 
327 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  39.41 
 
 
364 aa  230  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  53.04 
 
 
335 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  45.37 
 
 
316 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  43.8 
 
 
375 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  47.78 
 
 
341 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  42.29 
 
 
310 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  42.05 
 
 
378 aa  223  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  46.44 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  48.66 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  42.39 
 
 
322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  40.71 
 
 
332 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  52.38 
 
 
322 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  48.44 
 
 
303 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  46.09 
 
 
321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  48.13 
 
 
299 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  46.12 
 
 
318 aa  208  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  47.3 
 
 
292 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  44.98 
 
 
323 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  44.36 
 
 
327 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  39.22 
 
 
330 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  44.38 
 
 
346 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  48.28 
 
 
290 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  48.28 
 
 
290 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  48.28 
 
 
290 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  42.26 
 
 
292 aa  204  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  49.12 
 
 
296 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2592  LAO/AO transport system ATPase  45.23 
 
 
319 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  41.98 
 
 
343 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  45.08 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  37.59 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  40.71 
 
 
314 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  43.18 
 
 
334 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  44.01 
 
 
331 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  42.72 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  52.16 
 
 
321 aa  188  9e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  42.24 
 
 
346 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  43.23 
 
 
329 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  43.61 
 
 
329 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  46.25 
 
 
328 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  44.06 
 
 
372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  40.58 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  46.06 
 
 
332 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  42.53 
 
 
351 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  40.06 
 
 
330 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  39.73 
 
 
329 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2106  LAO/AO transport system ATPase  41.95 
 
 
330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  42.07 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  38.73 
 
 
330 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  38.49 
 
 
330 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  41.42 
 
 
325 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  41.42 
 
 
325 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  40.29 
 
 
333 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  42.15 
 
 
329 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  42.19 
 
 
333 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6417  LAO/AO transport system ATPase  45.97 
 
 
328 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  40.32 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  45.24 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  39.56 
 
 
329 aa  178  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  39.03 
 
 
336 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  41.85 
 
 
305 aa  176  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  35.35 
 
 
363 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>