15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2995 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  524  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  54.89 
 
 
271 aa  275  8e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  35.22 
 
 
287 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  31.87 
 
 
170 aa  51.2  2e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0498  hypothetical protein  40.45 
 
 
119 aa  50.4  3e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  25.81 
 
 
96 aa  48.9  8e-05  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  32.18 
 
 
171 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  28.09 
 
 
97 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  31.17 
 
 
97 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  28.16 
 
 
187 aa  45.4  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  30.59 
 
 
97 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  26.67 
 
 
97 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  24.65 
 
 
185 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  30 
 
 
97 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  28.26 
 
 
185 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>