More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2972 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  100 
 
 
237 aa  475  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  83.83 
 
 
238 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  56.39 
 
 
230 aa  283  2e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.35089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  56.9 
 
 
240 aa  280  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  56.17 
 
 
236 aa  278  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  57.01 
 
 
242 aa  278  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  54.94 
 
 
242 aa  273  2e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  58.56 
 
 
244 aa  272  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  56.56 
 
 
230 aa  272  4e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  55.11 
 
 
228 aa  271  6e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  56.11 
 
 
237 aa  271  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  56.56 
 
 
246 aa  270  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  55.16 
 
 
228 aa  268  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  55.36 
 
 
260 aa  268  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  55.16 
 
 
226 aa  269  4e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  56 
 
 
238 aa  268  6e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  56.89 
 
 
230 aa  266  3e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  56.09 
 
 
253 aa  265  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  58.41 
 
 
715 aa  265  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  55.71 
 
 
235 aa  263  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  54.75 
 
 
228 aa  262  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  56.62 
 
 
248 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  56.62 
 
 
248 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  52.61 
 
 
236 aa  262  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  56.05 
 
 
248 aa  261  5e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  55.66 
 
 
247 aa  261  6e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  56.56 
 
 
253 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  56.56 
 
 
253 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  54.3 
 
 
229 aa  260  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  52.04 
 
 
239 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  56.11 
 
 
224 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  52.19 
 
 
228 aa  259  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  56.22 
 
 
241 aa  259  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64483e-10 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  54.75 
 
 
244 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  55.36 
 
 
241 aa  259  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  53.85 
 
 
233 aa  259  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  54.3 
 
 
228 aa  258  4e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  54.3 
 
 
226 aa  258  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  56.42 
 
 
252 aa  258  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  58.3 
 
 
233 aa  258  7e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  53.02 
 
 
252 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 
224 aa  256  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  52.94 
 
 
225 aa  256  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  56.95 
 
 
233 aa  256  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  54.11 
 
 
247 aa  256  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 
226 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  54.3 
 
 
226 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  54.3 
 
 
226 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 
224 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
226 aa  255  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 
226 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  53.85 
 
 
226 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 
224 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  54.3 
 
 
226 aa  256  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  54.3 
 
 
226 aa  255  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
224 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  54.3 
 
 
229 aa  255  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
226 aa  255  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  53.39 
 
 
229 aa  255  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  3.79324e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
224 aa  254  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  54.3 
 
 
226 aa  254  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
224 aa  254  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  57.52 
 
 
238 aa  254  9e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
224 aa  254  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
224 aa  254  9e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 
224 aa  254  1e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
226 aa  253  2e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  54.75 
 
 
239 aa  253  2e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  52.49 
 
 
224 aa  253  2e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  56.11 
 
 
239 aa  252  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  58.17 
 
 
236 aa  252  4e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  53.3 
 
 
236 aa  252  4e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 
224 aa  252  5e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  55.41 
 
 
277 aa  251  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  53.36 
 
 
236 aa  251  7e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.08052e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  54.3 
 
 
232 aa  251  9e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  54.93 
 
 
244 aa  251  9e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  56.7 
 
 
241 aa  251  9e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  53.25 
 
 
248 aa  250  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  52.7 
 
 
227 aa  249  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  50.86 
 
 
256 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  55.2 
 
 
291 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  54.55 
 
 
241 aa  248  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  53.81 
 
 
255 aa  248  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  55.66 
 
 
254 aa  247  9e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  55.16 
 
 
233 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  54.02 
 
 
235 aa  246  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  49.58 
 
 
248 aa  246  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  53.64 
 
 
230 aa  245  4e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  2.00317e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  56.11 
 
 
227 aa  244  1e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  51.38 
 
 
259 aa  243  1e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  51.3 
 
 
240 aa  244  1e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  52.94 
 
 
225 aa  244  1e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  53.67 
 
 
254 aa  244  1e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  52.97 
 
 
234 aa  243  2e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  56.25 
 
 
241 aa  243  2e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  7.24399e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  52.86 
 
 
234 aa  243  2e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  51.83 
 
 
230 aa  243  2e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  51.39 
 
 
220 aa  243  2e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  52.97 
 
 
234 aa  243  2e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>