More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2908 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  566  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  50.69 
 
 
294 aa  238  6.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.87 
 
 
323 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  43.82 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  45.08 
 
 
294 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.8 
 
 
289 aa  209  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.4 
 
 
300 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.11 
 
 
317 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  30.51 
 
 
317 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 
309 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  31.14 
 
 
315 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  29.93 
 
 
312 aa  102  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  26.04 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  27.94 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  34.22 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.27 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  26.03 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  26.05 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.67 
 
 
291 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  26.67 
 
 
300 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  29.6 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.21 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  25 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  33.83 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.62 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  25.65 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.29 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  31.82 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.29 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  24.43 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.34 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.29 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  33.85 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  28.29 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  28.29 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  24.21 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.29 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  27.45 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.81 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  30.3 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  26.73 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  25.8 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.46 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  24.76 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.97 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.97 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.97 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  24.76 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  24.76 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.97 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  29.92 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  30 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  25.32 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  25 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  28.91 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  29.96 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.32 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.9 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.07 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.04 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  25.3 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  27.05 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  27.99 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.9 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  30 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  35.68 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.25 
 
 
397 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  31.25 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.59 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  24.03 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  24.91 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  28.67 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  29.54 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.88 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.24 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.2 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  30.9 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.11 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  26.01 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  27.44 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  24.3 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  29.43 
 
 
402 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  28.52 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  30.9 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  30.9 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>