More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2879 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  100 
 
 
312 aa  632  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  84.09 
 
 
326 aa  520  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  74.44 
 
 
321 aa  461  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  74.04 
 
 
327 aa  457  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  53.64 
 
 
304 aa  342  7e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  54.75 
 
 
320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  53.05 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
310 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  48.23 
 
 
323 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  51.16 
 
 
306 aa  315  8e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
318 aa  314  9e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  54.75 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  55.96 
 
 
325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  49.2 
 
 
319 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  54.58 
 
 
318 aa  312  4.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  50.97 
 
 
310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  51.48 
 
 
332 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  52.26 
 
 
348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  53.31 
 
 
321 aa  309  5e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  51.62 
 
 
314 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  51.62 
 
 
314 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  49.67 
 
 
304 aa  308  9e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  52.49 
 
 
311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  52.3 
 
 
311 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  49.2 
 
 
409 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  51.16 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  51.99 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  50.81 
 
 
321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  50.81 
 
 
321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  50.81 
 
 
321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  53.31 
 
 
321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  50.81 
 
 
318 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  50.81 
 
 
318 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  50.81 
 
 
318 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  50.81 
 
 
318 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  50.49 
 
 
318 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
333 aa  301  9e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
309 aa  301  9e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
318 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
315 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  50.16 
 
 
318 aa  299  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
311 aa  299  5e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  50.5 
 
 
311 aa  297  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.93 
 
 
407 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  48.85 
 
 
311 aa  297  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  48.36 
 
 
318 aa  296  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
318 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  48.17 
 
 
306 aa  296  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  53.8 
 
 
321 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  50.82 
 
 
345 aa  295  8e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  49.34 
 
 
309 aa  295  9e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  47.08 
 
 
310 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  49.34 
 
 
308 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  50 
 
 
314 aa  293  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
311 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  52.15 
 
 
312 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
331 aa  292  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  52.15 
 
 
317 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  47.9 
 
 
330 aa  291  7e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  49.36 
 
 
329 aa  291  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  50 
 
 
324 aa  291  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  49.69 
 
 
361 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  49.84 
 
 
335 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  46.53 
 
 
308 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  46.62 
 
 
460 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  47.91 
 
 
330 aa  290  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  50.83 
 
 
319 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  49.67 
 
 
336 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  51.16 
 
 
334 aa  289  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  49.84 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  46 
 
 
306 aa  288  6e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  49.84 
 
 
313 aa  288  6e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  49.67 
 
 
331 aa  288  9e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  48.67 
 
 
311 aa  288  9e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  47.19 
 
 
311 aa  288  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  48.67 
 
 
311 aa  288  9e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  48.88 
 
 
317 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  47.71 
 
 
456 aa  287  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  48.84 
 
 
316 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  51.3 
 
 
314 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  50.8 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  51.62 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  48.55 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  46 
 
 
306 aa  286  5e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  45.83 
 
 
316 aa  285  5e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  48.86 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  45.51 
 
 
316 aa  285  7e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  48.39 
 
 
321 aa  285  9e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  47.62 
 
 
346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  49.2 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  49.17 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  48.85 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  48.7 
 
 
348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  51.49 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  45.91 
 
 
318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  48.85 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  48.85 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>