More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2852 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
113 aa  226  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  69.03 
 
 
112 aa  152  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  61.95 
 
 
119 aa  140  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  44.33 
 
 
170 aa  83.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  50 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  43.18 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  43.18 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  43.18 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  43.18 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
220 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  51.85 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
113 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  40.66 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  40 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  42.05 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  42.05 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  42.05 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  40.91 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  39.76 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  39.77 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  45.12 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  40 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  40.21 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.59 
 
 
817 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  37.62 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  40.78 
 
 
278 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  44.44 
 
 
820 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  42.42 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  45.57 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  43.04 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  48.72 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  38.64 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  45.33 
 
 
97 aa  70.1  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  40.91 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  36.78 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  42.55 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  37.37 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  38.64 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  40.91 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  43.24 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  40.57 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 
476 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0588  putative NADH oxidase  43.04 
 
 
567 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  43.04 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  43.04 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  40.66 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.69 
 
 
390 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  40.66 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  40.37 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  41.84 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0828  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  38.1 
 
 
554 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0919827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3752  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.6 
 
 
551 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  36.89 
 
 
116 aa  67  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  40.59 
 
 
476 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0736  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  38.1 
 
 
554 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  43.24 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0670  NADH dehydrogenase  39.78 
 
 
554 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  37.37 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0774  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  38.1 
 
 
554 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.89 
 
 
478 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44 
 
 
566 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0935  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  38.1 
 
 
554 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000203969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  39.45 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  38.83 
 
 
471 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  41.84 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  38.71 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.35 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0684  NADH dehydrogenase  37.14 
 
 
554 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  36.59 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0868  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  37.14 
 
 
554 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>