More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2851 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 220 aa  453  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  72.43 
 
 		 216 aa  311  5.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  49.49 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  32.5 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  46.23 
 
 		 127 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  48.08 
 
 		 123 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 129 aa  101  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  46.23 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  44.55 
 
 		 129 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 		 480 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  50 
 
 		 132 aa  97.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  29.33 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  44.9 
 
 		 103 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  52.04 
 
 		 105 aa  96.7  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  39.22 
 
 		 118 aa  94.7  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  48.54 
 
 		 113 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 		 125 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  46.88 
 
 		 109 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  45.65 
 
 		 145 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  42.99 
 
 		 141 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  32.71 
 
 		 456 aa  91.7  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 133 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  44.66 
 
 		 141 aa  89  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  43.27 
 
 		 130 aa  89  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  44.32 
 
 		 121 aa  88.6  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  41.35 
 
 		 134 aa  88.6  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 		 472 aa  88.6  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 		 113 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 269 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  39.6 
 
 		 142 aa  88.2  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  54.12 
 
 		 102 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  31.78 
 
 		 470 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  43.88 
 
 		 108 aa  86.3  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  41.41 
 
 		 129 aa  85.5  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  31.18 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  44.33 
 
 		 112 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  44.33 
 
 		 127 aa  83.6  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  44.57 
 
 		 137 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  45.98 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  41.6 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  36.45 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  29.33 
 
 		 480 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  29.59 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  45.88 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  43.14 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 		 470 aa  81.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 		 279 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  43.52 
 
 		 356 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  43.43 
 
 		 105 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  41.38 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  44 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  31.33 
 
 		 541 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  31.33 
 
 		 568 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  42.24 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  31.33 
 
 		 568 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  42.22 
 
 		 565 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  40.74 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  34.17 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  43.62 
 
 		 138 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  39.39 
 
 		 103 aa  80.5  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  46.81 
 
 		 105 aa  80.5  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.11 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.11 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  44.58 
 
 		 116 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  30.9 
 
 		 555 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  30.9 
 
 		 541 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  41.9 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  41.82 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  41.82 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  43.01 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  32.09 
 
 		 527 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  42.42 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  32.56 
 
 		 527 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 		 463 aa  79  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 		 476 aa  79  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  41.82 
 
 		 356 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  42.35 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  40.37 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  40.74 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  48.68 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.95 
 
 		 390 aa  78.2  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  28.31 
 
 		 455 aa  78.2  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.01 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  48.28 
 
 		 177 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  38.83 
 
 		 141 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  43.68 
 
 		 122 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  39.58 
 
 		 98 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.86 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  39.05 
 
 		 116 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  44.87 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  44.21 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 113 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>