140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2846 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  83.2 
 
 		 381 aa  660    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  100 
 
 		 386 aa  786    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  61.79 
 
 		 392 aa  479  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  50 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  51.05 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  50.79 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  53.39 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  49.87 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  52.29 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  52.39 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  53.19 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  52.13 
 
 		 388 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  52.28 
 
 		 391 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  52.01 
 
 		 396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  47 
 
 		 393 aa  358  7e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  48.67 
 
 		 397 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  46.61 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  46.88 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  46.88 
 
 		 394 aa  355  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  47.38 
 
 		 392 aa  355  5e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  46.61 
 
 		 394 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  46.61 
 
 		 394 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  46.61 
 
 		 394 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  46.61 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  46.61 
 
 		 394 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  46.61 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  46.35 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  48.3 
 
 		 391 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  46.35 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  46.93 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  47 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  47.59 
 
 		 390 aa  349  5e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  50.94 
 
 		 389 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  49.1 
 
 		 390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  50.39 
 
 		 420 aa  342  5.999999999999999e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  51.06 
 
 		 390 aa  342  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  48.58 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  45.99 
 
 		 396 aa  338  8e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  46.74 
 
 		 392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  46.74 
 
 		 394 aa  335  5.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  50.41 
 
 		 392 aa  332  7.000000000000001e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  47.72 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  47.97 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  43.19 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  44 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  44 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  46.07 
 
 		 391 aa  325  8.000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  43.8 
 
 		 397 aa  325  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  43.58 
 
 		 385 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  43.86 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  46.26 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  44.19 
 
 		 407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1182  phosphopentomutase  43.11 
 
 		 403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2069  phosphopentomutase  43.11 
 
 		 403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0253086  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  43.77 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0816  phosphopentomutase  49.63 
 
 		 406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  43.77 
 
 		 396 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  44.81 
 
 		 404 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  43.69 
 
 		 407 aa  302  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  45.2 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  44.7 
 
 		 404 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  44.7 
 
 		 404 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  44.7 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2446  phosphopentomutase  43.3 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.892487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  44.27 
 
 		 409 aa  292  9e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  43.58 
 
 		 406 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  43.18 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1934  phosphopentomutase  45.66 
 
 		 406 aa  289  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  42.28 
 
 		 397 aa  290  4e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1825  phosphopentomutase  46.19 
 
 		 406 aa  290  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0453691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  45.41 
 
 		 405 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1219  phosphopentomutase  46.72 
 
 		 404 aa  289  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  44.61 
 
 		 407 aa  288  9e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  44.84 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  44.61 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  44.19 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  44.61 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  44.08 
 
 		 406 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  43.69 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1104  phosphopentomutase  45.71 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1043  phosphopentomutase  45.96 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000600335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  42.97 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1039  phosphopentomutase  45.96 
 
 		 404 aa  286  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536446  hitchhiker  0.0000000672539 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  39.45 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  43.14 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  43.24 
 
 		 407 aa  279  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5134  phosphopentomutase  46.33 
 
 		 407 aa  279  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  41.69 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  44.27 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  41.4 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  41.98 
 
 		 407 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  41.98 
 
 		 407 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0829  phosphopentomutase  45.88 
 
 		 418 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44144  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  43.11 
 
 		 407 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  40.74 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2813  phosphopentomutase  43.94 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00335296  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  41.73 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  41.73 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  41.73 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  41.73 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>