207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2815 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  100 
 
 
359 aa  725    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  70.81 
 
 
349 aa  484  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  54.23 
 
 
369 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  52.41 
 
 
358 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  52.16 
 
 
356 aa  315  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  54.6 
 
 
348 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  52.16 
 
 
357 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  50.29 
 
 
349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  46.05 
 
 
391 aa  291  8e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  46.05 
 
 
391 aa  285  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  42.05 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  41.94 
 
 
387 aa  271  9e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  40.96 
 
 
379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  41.34 
 
 
405 aa  268  8e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  41.01 
 
 
386 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  40.79 
 
 
386 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  42.21 
 
 
383 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  41.46 
 
 
389 aa  263  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  39.49 
 
 
382 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  39.49 
 
 
382 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  39.49 
 
 
382 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  39.49 
 
 
382 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  39.49 
 
 
382 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  44.93 
 
 
372 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  43.1 
 
 
383 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  39.49 
 
 
382 aa  259  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  40.23 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  40.23 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  40.23 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  39.2 
 
 
382 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  41.74 
 
 
404 aa  255  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  40.36 
 
 
389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  38.53 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  38.53 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  38.53 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  38.53 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  38.53 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  39.82 
 
 
350 aa  253  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  38.7 
 
 
382 aa  253  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  39.82 
 
 
350 aa  253  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  38.3 
 
 
387 aa  252  7e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  39.64 
 
 
355 aa  252  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  43.5 
 
 
385 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  38.48 
 
 
388 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  43.18 
 
 
389 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  38.4 
 
 
387 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  38.12 
 
 
387 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  39 
 
 
387 aa  247  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  41.16 
 
 
393 aa  247  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  39.13 
 
 
385 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  41.83 
 
 
387 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  40.67 
 
 
394 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  42.63 
 
 
391 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  40 
 
 
409 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  42.94 
 
 
405 aa  245  9e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  39.28 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  40.28 
 
 
398 aa  242  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  41.6 
 
 
396 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  42.12 
 
 
389 aa  242  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  46.25 
 
 
376 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  39.72 
 
 
403 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  37.92 
 
 
380 aa  238  9e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  42.9 
 
 
418 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  40.88 
 
 
384 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  43.31 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  39.3 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  38.1 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  36.71 
 
 
394 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  39.77 
 
 
351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  37.99 
 
 
385 aa  233  5e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  42.26 
 
 
414 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  39.15 
 
 
387 aa  232  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  44.32 
 
 
390 aa  232  9e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  36.36 
 
 
385 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  40.75 
 
 
392 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  38.44 
 
 
388 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  40.56 
 
 
401 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  39.89 
 
 
387 aa  229  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  36.95 
 
 
385 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  41.24 
 
 
392 aa  227  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  41.01 
 
 
388 aa  227  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  36.46 
 
 
392 aa  227  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  36.68 
 
 
351 aa  226  4e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4902  galactokinase  45.18 
 
 
379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  42.67 
 
 
361 aa  226  6e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  36.12 
 
 
389 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  37.36 
 
 
392 aa  225  8e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  37.64 
 
 
386 aa  224  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  39.35 
 
 
395 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  36.74 
 
 
383 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  37.18 
 
 
412 aa  222  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  43.79 
 
 
400 aa  223  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  36.94 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  39.35 
 
 
381 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  39.35 
 
 
381 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  39.35 
 
 
381 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  39.35 
 
 
381 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  37.3 
 
 
416 aa  218  8.999999999999998e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  42.53 
 
 
373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  38.87 
 
 
395 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>