More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2695 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2695  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  100 
 
 
453 aa  886    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0450627  normal  0.5058 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2385  fumarate lyase  51.81 
 
 
463 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3622  fumarate lyase  44.07 
 
 
456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3487  fumarate lyase  41.5 
 
 
450 aa  323  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4557  fumarate lyase  41.26 
 
 
449 aa  318  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3811  fumarate lyase  40.68 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0757  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  44.27 
 
 
457 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1439  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  43.61 
 
 
460 aa  312  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2418  fumarate lyase  41.55 
 
 
448 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4409  fumarate lyase  41.44 
 
 
446 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1072  adenylosuccinate lyase  44.84 
 
 
455 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1483  fumarate lyase  41.08 
 
 
450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151746  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0014  fumarate lyase  41.48 
 
 
450 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000353189  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04011  conserved hypothetical protein  41.73 
 
 
476 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981247  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4598  fumarate lyase  40.87 
 
 
458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2125  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.45 
 
 
453 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2341  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.36 
 
 
453 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2745  fumarate lyase  41.28 
 
 
473 aa  293  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.0578708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1379  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.35 
 
 
450 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449914  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4344  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.35 
 
 
450 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  42.02 
 
 
450 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531997 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4015  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.96 
 
 
490 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0773124  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4459  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.22 
 
 
476 aa  273  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21250  adenylosuccinate lyase  39.77 
 
 
452 aa  269  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0991556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1273  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.6 
 
 
454 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3127  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.2 
 
 
457 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5023  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.42 
 
 
462 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.261629  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2505  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.74 
 
 
452 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4374  adenylosuccinate lyase  34.75 
 
 
451 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.25048e-22 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4435  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.72 
 
 
450 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.115184  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38190  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.4 
 
 
450 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0645  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.15 
 
 
459 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0741414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3160  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.12 
 
 
457 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1536  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.01 
 
 
438 aa  256  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157227  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  34.79 
 
 
454 aa  256  8e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5286  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.78 
 
 
451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335784  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1555  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.67 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0056  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.67 
 
 
452 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0457569  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.67 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0058  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.67 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1485  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.67 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1202  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.67 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0069  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.67 
 
 
452 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675451  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.98 
 
 
460 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.81 
 
 
465 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18830  adenylosuccinate lyase  38.75 
 
 
477 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0801563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1630  adenylosuccinate lyase  41.18 
 
 
477 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4314  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.61 
 
 
459 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417348  normal  0.728676 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02908  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.72 
 
 
450 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5748  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.76 
 
 
452 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955684  normal  0.122503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7931  3-carboxy-cis,cis-muconate cyclo-isomerase  41.03 
 
 
452 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2084  fumarate lyase  41.99 
 
 
451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  34.71 
 
 
454 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2456  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.27 
 
 
453 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786558  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1906  putative lyase  36.14 
 
 
445 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2251  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  42.21 
 
 
453 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.001838  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4475  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.76 
 
 
452 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5111  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  43.65 
 
 
406 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1657  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  42.21 
 
 
404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.919998 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3997  adenylosuccinate lyase  33.18 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00709346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4654  fumarate lyase  42.47 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179746  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4188  adenylosuccinate lyase  33.41 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0280  adenylosuccinate lyase  34.99 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1855  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  42.32 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6130  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  42.35 
 
 
352 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0316  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.86 
 
 
459 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2052  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  42.81 
 
 
354 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.493793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02830  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.4 
 
 
459 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2063  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.37 
 
 
453 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146832  normal  0.884924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0555  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.37 
 
 
357 aa  226  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141061  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4654  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.16 
 
 
464 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0817649  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5054  fumarate lyase  36.12 
 
 
456 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0605282  normal  0.269052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18850  adenylosuccinate lyase  36.22 
 
 
483 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110706 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3496  fumarate lyase  41.53 
 
 
433 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0886994  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2958  adenylosuccinate lyase  35.11 
 
 
471 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121926  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1631  adenylosuccinate lyase  35.97 
 
 
483 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3210  adenylosuccinate lyase  36.64 
 
 
452 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127423  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1579  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  41.87 
 
 
448 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.13236  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4837  fumarate lyase  35.15 
 
 
450 aa  217  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.616525  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2833  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  42.41 
 
 
464 aa  216  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23357  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5943  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.35 
 
 
348 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3729  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.95 
 
 
354 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1393  adenylosuccinate lyase  35.49 
 
 
455 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00268576  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4874  fumarate lyase  35.89 
 
 
456 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0760075  normal  0.0695852 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1582  adenylosuccinate lyase  35.23 
 
 
455 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2457  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  42.43 
 
 
383 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00336692  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1055  fumarate lyase  36.3 
 
 
488 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7081  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.23 
 
 
348 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  34.47 
 
 
445 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0005  adenylosuccinate lyase  36.53 
 
 
454 aa  204  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3324  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.76 
 
 
402 aa  204  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  32.25 
 
 
446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1662  fumarate lyase  37.62 
 
 
438 aa  201  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  32.79 
 
 
446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0298  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.13 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  34.81 
 
 
431 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  34.81 
 
 
431 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  32.13 
 
 
446 aa  196  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4818  fumarate lyase  33.67 
 
 
451 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.327057  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  32.83 
 
 
448 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>