More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2689 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
395 aa  801  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  3.31787e-06  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  36.21 
 
 
410 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  37.75 
 
 
387 aa  239  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  36.11 
 
 
414 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  34.76 
 
 
397 aa  236  5e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  32.99 
 
 
392 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 
392 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  36.19 
 
 
395 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  35.29 
 
 
389 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  33 
 
 
392 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  35.36 
 
 
402 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  34.71 
 
 
390 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  33.7 
 
 
392 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  33.95 
 
 
395 aa  223  5e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  35.76 
 
 
390 aa  222  9e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  35.07 
 
 
402 aa  222  1e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  35.31 
 
 
397 aa  221  2e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  34.37 
 
 
393 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  36.28 
 
 
394 aa  220  4e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
388 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  31.89 
 
 
392 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 
395 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
388 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  34.41 
 
 
390 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  35.59 
 
 
390 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  34.51 
 
 
393 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  35.57 
 
 
387 aa  215  1e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  35.78 
 
 
392 aa  214  2e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05301e-07 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  32.15 
 
 
390 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  34.05 
 
 
395 aa  209  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  31.9 
 
 
412 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  31.49 
 
 
390 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 
391 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  34.99 
 
 
395 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  32.32 
 
 
391 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  31.39 
 
 
392 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  33.16 
 
 
391 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  3.12387e-06 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  33.6 
 
 
395 aa  201  2e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  31.34 
 
 
390 aa  197  2e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 
389 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  30.99 
 
 
401 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  32.43 
 
 
392 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  33.16 
 
 
406 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  32.35 
 
 
390 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  32.62 
 
 
390 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  31.39 
 
 
390 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  32.34 
 
 
389 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
392 aa  190  3e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  32.9 
 
 
390 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  30.89 
 
 
390 aa  189  6e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0821  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
368 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  32.97 
 
 
390 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 
413 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  31.97 
 
 
406 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 
391 aa  184  2e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  31.72 
 
 
390 aa  184  2e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  30.96 
 
 
391 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 
395 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 
399 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 
388 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  32.14 
 
 
384 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 
396 aa  179  6e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
388 aa  179  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 
390 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  28.46 
 
 
397 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  32.2 
 
 
390 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  32.01 
 
 
390 aa  174  2e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  30.48 
 
 
390 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  32.65 
 
 
398 aa  163  5e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  29.58 
 
 
381 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  32.48 
 
 
396 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 
407 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 
379 aa  155  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
390 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 
426 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  29.78 
 
 
395 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 
376 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 
390 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  27.88 
 
 
423 aa  149  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 
401 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 
389 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 
389 aa  146  7e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.82 
 
 
399 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 
400 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
389 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
379 aa  141  2e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  28.61 
 
 
405 aa  141  2e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  28.87 
 
 
405 aa  141  2e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.82907e-05 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  28.87 
 
 
405 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
386 aa  140  4e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 
411 aa  140  5e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  28.53 
 
 
405 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  28.53 
 
 
405 aa  139  9e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  28.28 
 
 
405 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.7926e-14 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0667  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  31.52 
 
 
423 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  28.61 
 
 
405 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  28.28 
 
 
405 aa  137  3e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 
405 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1931  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.77 
 
 
395 aa  136  6e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 
417 aa  132  8e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>