More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2659 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
334 aa  654  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.84 
 
 
334 aa  521  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.38 
 
 
345 aa  396  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.73 
 
 
334 aa  371  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  52.4 
 
 
333 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  52.35 
 
 
351 aa  358  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  52.65 
 
 
339 aa  356  3e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  51.61 
 
 
339 aa  356  3e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  51.61 
 
 
339 aa  356  4e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  52.06 
 
 
339 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  51.93 
 
 
337 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  51.19 
 
 
336 aa  348  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.27 
 
 
336 aa  348  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.49 
 
 
336 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  51.49 
 
 
336 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  50.88 
 
 
339 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  50.88 
 
 
339 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  51.19 
 
 
336 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  50.6 
 
 
336 aa  346  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.79 
 
 
334 aa  346  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.23 
 
 
336 aa  346  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  51.19 
 
 
336 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.19 
 
 
336 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.19 
 
 
336 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  50.15 
 
 
339 aa  345  9e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  50.73 
 
 
339 aa  344  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  50.15 
 
 
339 aa  344  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  50.15 
 
 
339 aa  344  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  50.15 
 
 
381 aa  344  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  50.15 
 
 
339 aa  344  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.45 
 
 
335 aa  344  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  50.15 
 
 
339 aa  344  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  51.19 
 
 
336 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  50.15 
 
 
339 aa  344  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  50.15 
 
 
339 aa  344  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  50.15 
 
 
339 aa  344  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  52.23 
 
 
336 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  50.15 
 
 
339 aa  344  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  49.85 
 
 
339 aa  343  3e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  49.85 
 
 
339 aa  343  3e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  49.85 
 
 
339 aa  343  3e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  49.85 
 
 
339 aa  343  3e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.45 
 
 
336 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  50.89 
 
 
336 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  52.23 
 
 
336 aa  338  6e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 
336 aa  338  6e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  50.74 
 
 
339 aa  338  9e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  51.93 
 
 
336 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  51.93 
 
 
336 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  51.93 
 
 
336 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.45 
 
 
336 aa  337  1e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.68 
 
 
334 aa  337  1e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  50.45 
 
 
336 aa  338  1e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  51.34 
 
 
336 aa  337  2e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  50.3 
 
 
336 aa  337  2e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  51.19 
 
 
336 aa  336  4e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.6 
 
 
346 aa  335  6e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.16 
 
 
333 aa  334  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  3.22853e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  50.3 
 
 
336 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  49.55 
 
 
335 aa  332  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  49.85 
 
 
335 aa  332  6e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  49.26 
 
 
335 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  50 
 
 
334 aa  329  5e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.75 
 
 
332 aa  327  1e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.08 
 
 
334 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.91 
 
 
334 aa  322  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  50.45 
 
 
336 aa  322  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.04 
 
 
335 aa  322  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  49.11 
 
 
338 aa  320  1e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  49.11 
 
 
338 aa  320  1e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  50 
 
 
336 aa  321  1e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  49.7 
 
 
336 aa  320  2e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.54 
 
 
334 aa  320  2e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  49.7 
 
 
336 aa  320  2e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  49.11 
 
 
338 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  49.11 
 
 
338 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.25 
 
 
306 aa  320  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  50.76 
 
 
335 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.33 
 
 
334 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  48.63 
 
 
334 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  50.15 
 
 
335 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.15 
 
 
335 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.92 
 
 
334 aa  312  5e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00673258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12510  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  49.85 
 
 
336 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0113626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.08 
 
 
334 aa  309  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.26 
 
 
315 aa  308  9e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.2 
 
 
334 aa  308  1e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  45.66 
 
 
359 aa  306  4e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.55 
 
 
339 aa  305  5e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.29 
 
 
308 aa  306  5e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.11261e-08  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.31 
 
 
334 aa  301  7e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
338 aa  302  7e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.09 
 
 
347 aa  297  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.36 
 
 
335 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.41 
 
 
336 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290985  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1527  nickel-transporting ATPase  46.43 
 
 
338 aa  295  5e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01740  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  48.94 
 
 
334 aa  292  5e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.01 
 
 
308 aa  292  5e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.24 
 
 
338 aa  291  9e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0353588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.27 
 
 
338 aa  291  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>