241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2640 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  100 
 
 
307 aa  627  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  78.83 
 
 
307 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  46.18 
 
 
306 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  44.22 
 
 
305 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  43.56 
 
 
305 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  46.79 
 
 
310 aa  258  8e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  42.24 
 
 
305 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  42.24 
 
 
305 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  42.24 
 
 
305 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  42.24 
 
 
305 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  42.24 
 
 
305 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  41.91 
 
 
305 aa  255  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  41.91 
 
 
305 aa  255  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  41.91 
 
 
305 aa  255  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  41.91 
 
 
305 aa  255  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  41.91 
 
 
305 aa  255  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  41.91 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  45.36 
 
 
331 aa  248  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  44.59 
 
 
307 aa  246  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  39.6 
 
 
306 aa  232  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  42.35 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  40.59 
 
 
308 aa  212  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  44.33 
 
 
308 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  42.12 
 
 
306 aa  209  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  41.18 
 
 
305 aa  209  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  40.33 
 
 
306 aa  208  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  40.85 
 
 
306 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  40.58 
 
 
311 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  43.06 
 
 
311 aa  200  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  38.91 
 
 
317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  40.06 
 
 
317 aa  195  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  36.74 
 
 
318 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  36.74 
 
 
318 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  36.74 
 
 
318 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  41.99 
 
 
307 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  38.14 
 
 
317 aa  189  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  37.41 
 
 
306 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  37.79 
 
 
309 aa  185  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  32.99 
 
 
333 aa  185  7e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  38.49 
 
 
329 aa  185  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  38.03 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  38.16 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  32.78 
 
 
333 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  32.78 
 
 
333 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  38.27 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  38.38 
 
 
306 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  38.03 
 
 
308 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  37.91 
 
 
278 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  37.1 
 
 
306 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  36.84 
 
 
319 aa  176  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  35.56 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  38.08 
 
 
308 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  35.97 
 
 
279 aa  168  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  37.81 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  35.93 
 
 
295 aa  165  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  35.74 
 
 
277 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  28.38 
 
 
318 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  34.95 
 
 
290 aa  155  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  35.61 
 
 
279 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  32.28 
 
 
319 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  37.94 
 
 
309 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  31.6 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  28.23 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  28.96 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.45 
 
 
1003 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.56 
 
 
993 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.01 
 
 
1001 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.31 
 
 
993 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  29.57 
 
 
996 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  30.71 
 
 
286 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.95 
 
 
991 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.95 
 
 
991 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.71 
 
 
1001 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.81 
 
 
990 aa  96.3  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28 
 
 
991 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.3 
 
 
1006 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.04 
 
 
1004 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.88 
 
 
1003 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.82 
 
 
1004 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.13 
 
 
1013 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.48 
 
 
1002 aa  89  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0714  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.69 
 
 
1059 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000141926  unclonable  0.0000000428455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.53 
 
 
1004 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2676  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.67 
 
 
1058 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0314551  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2369  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.02 
 
 
1323 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.557702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2268  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.02 
 
 
1323 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2037  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.02 
 
 
1323 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.851494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0615  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.69 
 
 
1059 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.381714  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0169  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.16 
 
 
1039 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0936263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.47 
 
 
1040 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0103  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25 
 
 
1046 aa  80.9  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0689  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.24 
 
 
1064 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000102631  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  28.16 
 
 
975 aa  79.7  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2931  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.71 
 
 
1323 aa  79.7  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.637197  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4017  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.33 
 
 
1322 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0568  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.92 
 
 
1064 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  25.24 
 
 
1191 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0398  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.08 
 
 
1041 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3489  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.39 
 
 
1320 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.376631  normal  0.245835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0521  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.76 
 
 
1317 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0520721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>