More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2630 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  100 
 
 
472 aa  891    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  69.57 
 
 
456 aa  588  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1415  MATE efflux family protein  40.49 
 
 
466 aa  210  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.167041 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  26.98 
 
 
445 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  27.35 
 
 
453 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  27.14 
 
 
461 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  28.79 
 
 
461 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  28.29 
 
 
461 aa  136  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  24.27 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  23.45 
 
 
463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  23.45 
 
 
463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  25.23 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  23.87 
 
 
460 aa  123  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  26.73 
 
 
461 aa  120  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
454 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  25.11 
 
 
458 aa  117  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.52 
 
 
468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.57 
 
 
483 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  26.06 
 
 
458 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  28.1 
 
 
459 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  23.32 
 
 
458 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  23.32 
 
 
458 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.78 
 
 
453 aa  110  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
469 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.75 
 
 
458 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  24.83 
 
 
458 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  24.78 
 
 
459 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  23.92 
 
 
449 aa  105  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  24.42 
 
 
460 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
459 aa  103  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  23.99 
 
 
484 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  24.67 
 
 
484 aa  103  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
467 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  29.25 
 
 
451 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  23.79 
 
 
455 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  24.4 
 
 
484 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  24.66 
 
 
546 aa  100  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  24.18 
 
 
546 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  24.18 
 
 
484 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  24.51 
 
 
495 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  24.44 
 
 
495 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  24.94 
 
 
480 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  28.41 
 
 
434 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  24.44 
 
 
547 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  24.44 
 
 
547 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  20.86 
 
 
479 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  28.54 
 
 
458 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  27.87 
 
 
465 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.52 
 
 
464 aa  94.4  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
466 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.09 
 
 
464 aa  93.6  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.83 
 
 
452 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  25.39 
 
 
462 aa  92.8  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.68 
 
 
462 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  28.86 
 
 
462 aa  91.3  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  21.29 
 
 
446 aa  90.1  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  26.19 
 
 
451 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  26.26 
 
 
502 aa  89.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  24.06 
 
 
464 aa  89.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  25.73 
 
 
457 aa  89  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  28.68 
 
 
467 aa  87.8  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  26.21 
 
 
466 aa  87  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  22.47 
 
 
456 aa  87  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  27.42 
 
 
470 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
467 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  23.6 
 
 
449 aa  85.1  0.000000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  23.41 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  20.59 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
500 aa  83.6  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.75 
 
 
445 aa  83.6  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.83 
 
 
450 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  25.2 
 
 
466 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  22.34 
 
 
461 aa  82  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  22.77 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  26.13 
 
 
454 aa  81.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  27.54 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2533  multi anti extrusion protein MatE  30.17 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000103349  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  21.85 
 
 
440 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
469 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  29.81 
 
 
450 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  24.58 
 
 
481 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
498 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  22.1 
 
 
467 aa  78.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  23.13 
 
 
474 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
469 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  25.47 
 
 
460 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  21.44 
 
 
464 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  20.98 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  23.81 
 
 
476 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  28.36 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  26.34 
 
 
486 aa  78.6  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  21.73 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
449 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  23.7 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  23.3 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  26.48 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  26.06 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>