More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2624 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2624  30S ribosomal protein S12  100 
 
 
138 aa  273  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  5.52514e-05  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2912  ribosomal protein S12  93.6 
 
 
137 aa  241  2e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  1.87241e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1873  30S ribosomal protein S12  86.78 
 
 
136 aa  214  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.474423  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
123 aa  199  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  195  2e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2823  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
123 aa  195  2e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0494947 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
123 aa  194  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
123 aa  194  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 
136 aa  193  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  72.59 
 
 
135 aa  192  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  67.79 
 
 
146 aa  192  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  8.46161e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  72.39 
 
 
137 aa  192  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1833  30S ribosomal protein S12  72.58 
 
 
202 aa  191  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0567288  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  69.63 
 
 
135 aa  192  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  2.00867e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1201  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
123 aa  191  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.449722  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  192  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.17432e-05  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_004310  BR1238  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
123 aa  191  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 
126 aa  191  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
124 aa  191  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
124 aa  191  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
124 aa  190  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2962  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 
123 aa  190  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.330049  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1098  ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  190  6e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
126 aa  190  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1800  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  190  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278795  normal  0.143842 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
126 aa  190  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 
125 aa  190  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.34966e-11  unclonable  8.17173e-08 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
126 aa  190  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
125 aa  190  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
125 aa  190  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
126 aa  190  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
126 aa  189  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
126 aa  189  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
126 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1951  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 
123 aa  189  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  1.65732e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
126 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
126 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
126 aa  189  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  3.94059e-07  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
126 aa  189  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
126 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
126 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
126 aa  189  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0981  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 
123 aa  189  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.808535  normal  0.0659851 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
126 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
125 aa  189  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
126 aa  189  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.11216e-08  hitchhiker  9.29733e-10 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 
137 aa  189  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
123 aa  189  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1327  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 
123 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139307  normal  0.0632073 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
123 aa  189  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
126 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
125 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1425  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 
123 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469141  normal  0.0235591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
125 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
125 aa  188  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  2.16597e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  75.4 
 
 
126 aa  188  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  4.2248e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 
125 aa  188  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  73.81 
 
 
129 aa  188  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  1.8595e-11  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
125 aa  188  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  1.33028e-06 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 
135 aa  188  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
125 aa  188  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  1.2453e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 
124 aa  188  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
123 aa  188  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1115  ribosomal protein S12  74.19 
 
 
124 aa  188  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
125 aa  188  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  1.17431e-08  n/a   
 
 
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
123 aa  188  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
123 aa  187  3e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  74.19 
 
 
124 aa  187  3e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  70.29 
 
 
144 aa  188  3e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
125 aa  187  3e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0693  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 
123 aa  187  3e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.27901e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 
125 aa  187  3e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0661  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 
123 aa  187  3e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.91952e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1674  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 
123 aa  187  3e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  hitchhiker  0.0029615 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  75 
 
 
124 aa  187  3e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
123 aa  187  3e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  2.84598e-07 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  70.29 
 
 
144 aa  188  3e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  1.29313e-06  hitchhiker  3.34928e-05 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  71.97 
 
 
128 aa  187  3e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  5.94982e-05  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0801  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
123 aa  187  3e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.208097  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  75.61 
 
 
125 aa  187  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  187  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  187  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
124 aa  187  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 
124 aa  187  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0400  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
125 aa  187  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  3.78884e-05  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 
124 aa  187  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 
124 aa  187  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
125 aa  186  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
124 aa  186  8e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
125 aa  186  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  1.53437e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  74.02 
 
 
127 aa  186  8e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  73.39 
 
 
124 aa  186  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  75.21 
 
 
123 aa  186  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1606  ribosomal protein S12  75.81 
 
 
126 aa  186  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.524218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 
124 aa  186  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 
124 aa  186  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 
124 aa  186  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1950  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 
123 aa  186  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  73.23 
 
 
127 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  73.23 
 
 
127 aa  186  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>