More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2623 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2623  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
156 aa  316  6e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000189797  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2911  ribosomal protein S7  84.62 
 
 
156 aa  234  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000104481  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1872  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  230  7e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.339504  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  188  3e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  187  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  185  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  57.79 
 
 
155 aa  184  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  184  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  184  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  184  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  184  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  182  1e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  182  1e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  5.4268e-11  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  182  1e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  182  1e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  181  2e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  3.45641e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  182  2e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  182  2e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  181  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  180  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  180  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  180  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  180  8e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  180  8e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  179  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  179  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  178  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  178  3e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.3208e-06  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  178  3e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  178  3e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  178  3e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  178  3e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  177  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
155 aa  176  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.49604e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
155 aa  176  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  1.10546e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1312  30S ribosomal protein S7  54.84 
 
 
156 aa  176  9e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  176  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.70955e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  176  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  50.64 
 
 
156 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  176  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  4.45482e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  176  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  8.83465e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  175  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  5.71074e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  54.19 
 
 
156 aa  175  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  175  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  54.19 
 
 
156 aa  174  3e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  54.19 
 
 
156 aa  174  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  54.19 
 
 
156 aa  174  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  175  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  174  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.40353e-07  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2763  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  174  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 
157 aa  174  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1097  ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  174  5e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  52.9 
 
 
156 aa  174  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  1.14638e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  173  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  6.10678e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  53.55 
 
 
156 aa  173  7e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  173  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.57389e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  173  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0854  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 
156 aa  173  8e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.633412  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 
157 aa  173  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.12886e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  173  1e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 
155 aa  172  1e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  172  1e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  5.74292e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  172  1e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3648  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  172  1e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.51904e-07  hitchhiker  8.98288e-10 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2844  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  172  1e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507183  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  51.28 
 
 
156 aa  172  2e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  1.89839e-05  hitchhiker  4.25179e-05 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 
155 aa  171  2e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  5.63067e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
155 aa  172  2e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.45029e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  172  2e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  171  2e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  172  2e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  2.96735e-12  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  171  3e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  2.87313e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  171  3e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  171  4e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  171  4e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 
156 aa  171  4e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.39374e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  171  4e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  171  4e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  171  4e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  171  4e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  51.28 
 
 
156 aa  171  4e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  171  4e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  1.62716e-05  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  171  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.50114e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  171  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0188  ribosomal protein S7  51.92 
 
 
156 aa  170  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>