259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2611 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
74 aa  147  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2899  ribosomal protein L29  73.85 
 
 
65 aa  97.1  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  51.67 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
74 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  47.62 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  52.63 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  50.88 
 
 
77 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  45.07 
 
 
77 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  53.57 
 
 
71 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  40.58 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl131  50S ribosomal protein L29  43.94 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 
62 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  49.12 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  43.28 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  49.09 
 
 
65 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_009972  Maur_5050  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0326432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  49.15 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  41.79 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0688  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  52.73 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
66 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  42.62 
 
 
80 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  39.68 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  43.28 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  46.67 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  42.59 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0699  50S ribosomal protein L29  44.12 
 
 
74 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000396079  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 
69 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  42.59 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  43.1 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  44.64 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  48.21 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  38.81 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  42.37 
 
 
71 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23101  50S ribosomal protein L29  36.76 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 
69 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 
69 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 
66 aa  50.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  42.19 
 
 
68 aa  50.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
67 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 
69 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  45.76 
 
 
63 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 
66 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
61 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1941  50S ribosomal protein L29  43.06 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0595  ribosomal protein L29  44.07 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.978354 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1938  50S ribosomal protein L29  43.06 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  46.43 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  38.33 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  40 
 
 
72 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2026  50S ribosomal protein L29  43.06 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2364  ribosomal protein L29  45.76 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.649847  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  40.74 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16701  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
70 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1963  50S ribosomal protein L29  38.24 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  47.27 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  46.43 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  41.38 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  39.34 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  37.31 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  43.55 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 
69 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0406  ribosomal protein L29  46.43 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2974  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.997663  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>