More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2610 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 97 aa  194  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  82.47 
 
 		 97 aa  161  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  60.53 
 
 		 83 aa  100  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 80 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 80 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 80 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 80 aa  98.6  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 80 aa  98.6  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3434  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0295981  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 78 aa  97.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 79 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 79 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3990  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  54.74 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  56 
 
 		 78 aa  94  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0059  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000129273  hitchhiker  1.52646e-17 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 		 82 aa  93.6  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 80 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1273  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 80 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 100 aa  92.8  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 80 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3786  30S ribosomal protein S17  61.43 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164158  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4904  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.049648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 80 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 		 79 aa  90.5  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  55 
 
 		 92 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 82 aa  88.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0265  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.696196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0212  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  53.75 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  53.75 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  53.75 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0400  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  53.75 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  53.85 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 		 88 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 		 88 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 		 76 aa  86.7  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 		 80 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  50.65 
 
 		 88 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 		 88 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 		 81 aa  85.5  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  52.86 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1822  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  54.93 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  55.71 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  50.67 
 
 		 76 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>