More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2608 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
109 aa  216  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  3.38096e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  65.74 
 
 
113 aa  148  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  59.43 
 
 
106 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.32797e-05  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 
116 aa  120  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  57.8 
 
 
110 aa  118  2e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  2.98754e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 
104 aa  117  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  54.72 
 
 
108 aa  117  8e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
104 aa  115  2e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  55.66 
 
 
107 aa  115  2e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  54.72 
 
 
109 aa  114  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.97674e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  112  2e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
107 aa  110  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 
106 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.70602e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  54.21 
 
 
106 aa  108  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
105 aa  105  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.35301e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
105 aa  105  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  49.51 
 
 
109 aa  104  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 
105 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 
115 aa  104  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  49.06 
 
 
106 aa  103  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  48.6 
 
 
107 aa  103  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
103 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  48.57 
 
 
106 aa  102  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
108 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
108 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  47.62 
 
 
106 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  47.17 
 
 
116 aa  100  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  4.40948e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  47.17 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.32884e-06  hitchhiker  1.26153e-07 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
108 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.69052e-11  hitchhiker  1.15674e-08 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0691  50S ribosomal protein L24  49.06 
 
 
108 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  48.04 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 
108 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 
108 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79299e-11 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  44.76 
 
 
103 aa  97.8  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  44.76 
 
 
103 aa  97.4  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  7.81328e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  44.76 
 
 
103 aa  97.4  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  2.82756e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  49.06 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  44.76 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  45.95 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  45.95 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  1.88954e-05 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.84056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  49.51 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.39235e-05  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  45.05 
 
 
110 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  42.06 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  42.72 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.03774e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.36575e-10  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  5.45325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.07051e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.77787e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.11062e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.83187e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.27512e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09018e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  42.06 
 
 
107 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  47 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  47 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  48 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  42.72 
 
 
105 aa  87  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  48.51 
 
 
105 aa  87  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  3.01536e-07  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  41.51 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1274  ribosomal protein L24  44.25 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  7.19742e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  40.19 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  1.54774e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0778  50S ribosomal protein L24  44.76 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0177963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4925  ribosomal protein L24  47.31 
 
 
93 aa  83.2  1e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0021231  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  41.12 
 
 
107 aa  82.8  1e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 
107 aa  82.4  2e-15  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.72359e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  41.96 
 
 
110 aa  82.4  2e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  44.14 
 
 
118 aa  82.4  2e-15  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 
107 aa  82.4  2e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  44.86 
 
 
105 aa  82  2e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  7.60345e-07  unclonable  2.81859e-10 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
105 aa  82  3e-15  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  7.17269e-06 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  43.4 
 
 
104 aa  80.9  6e-15  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  5.30898e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  40.19 
 
 
106 aa  80.5  7e-15  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  47.96 
 
 
105 aa  80.5  8e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 
105 aa  79.7  1e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0878  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 
107 aa  79  2e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0510214  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  43.93 
 
 
114 aa  79  2e-14  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  40.78 
 
 
112 aa  78.6  2e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 
104 aa  79.3  2e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  41.18 
 
 
115 aa  78.2  3e-14  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  43.27 
 
 
106 aa  78.6  3e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  42.06 
 
 
105 aa  77.8  4e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3984  ribosomal protein L24  45.36 
 
 
122 aa  78.2  4e-14  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 
108 aa  77.8  5e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0416  50S ribosomal protein L24P  42.45 
 
 
107 aa  77.4  6e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  1.10454e-05  normal  0.227235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  41.12 
 
 
122 aa  77.4  7e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  42.31 
 
 
102 aa  76.6  9e-14  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  54.17 
 
 
80 aa  76.3  1e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
80 aa  76.3  1e-13  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  1.23735e-08  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3994  ribosomal protein L24  38.32 
 
 
109 aa  76.6  1e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
104 aa  76.6  1e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1407  ribosomal protein L24  39.8 
 
 
101 aa  75.9  2e-13  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>