More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2604 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2604  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000953175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  72 
 
 		 180 aa  252  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1852  50S ribosomal protein L6  60.36 
 
 		 185 aa  210  7e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.668423 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 178 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  56.5 
 
 		 180 aa  191  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 178 aa  191  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  55.88 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  55.31 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  54.24 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.41 
 
 		 178 aa  184  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  51.76 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  52.15 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  180  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  52.69 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  53.23 
 
 		 187 aa  177  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 179 aa  177  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  54.97 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  53.04 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  52.22 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  53.22 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 178 aa  174  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  174  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  51.38 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  50.83 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  51.89 
 
 		 184 aa  171  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  51.18 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  53.85 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 178 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 178 aa  169  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  50.59 
 
 		 182 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  44.69 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  51.96 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 181 aa  167  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  167  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  52.22 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  51.93 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 178 aa  164  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 179 aa  163  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  48.91 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  48.91 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>