More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2594 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 126 aa  249  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  92.06 
 
 		 126 aa  234  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  75.4 
 
 		 126 aa  192  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  74.59 
 
 		 122 aa  191  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  71.54 
 
 		 125 aa  184  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2628  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 126 aa  177  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  177  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 123 aa  176  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 124 aa  176  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  68.8 
 
 		 125 aa  176  9e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  67.48 
 
 		 124 aa  176  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  67.46 
 
 		 126 aa  175  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  68.85 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  68.29 
 
 		 124 aa  175  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 124 aa  174  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  66.4 
 
 		 125 aa  174  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 123 aa  173  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 124 aa  173  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 123 aa  172  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  65.35 
 
 		 127 aa  173  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  69.49 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  64.8 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  61.9 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 123 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3115  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 126 aa  171  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 123 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  65.85 
 
 		 124 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  65.08 
 
 		 126 aa  170  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 124 aa  170  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  62.7 
 
 		 126 aa  170  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  64.29 
 
 		 126 aa  169  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 124 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  63.2 
 
 		 125 aa  169  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  65.29 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 124 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 124 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 123 aa  168  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 124 aa  169  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  64.29 
 
 		 126 aa  168  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  62.7 
 
 		 126 aa  167  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  167  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 124 aa  167  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  167  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  60.66 
 
 		 122 aa  167  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 123 aa  166  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  167  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  63.41 
 
 		 123 aa  167  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  166  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 123 aa  166  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  62.9 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  64.1 
 
 		 126 aa  164  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  62.39 
 
 		 126 aa  163  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  163  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  58.73 
 
 		 126 aa  163  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  62.9 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 129 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  59.2 
 
 		 124 aa  161  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4482  30S ribosomal protein S13  61.54 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0331  30S ribosomal protein S13  65.87 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13028  decreased coverage  0.000403081 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2036  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.818597  normal  0.51135 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6025  30S ribosomal protein S13  60.68 
 
 		 126 aa  160  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  60.8 
 
 		 125 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0607  30S ribosomal protein S13  59.83 
 
 		 126 aa  160  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2989  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  159  9e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.183417 
 
 
-
 
NC_002936  DET0499  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000323492  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  57.85 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  60.63 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>