More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2588 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  100 
 
 
247 aa  500  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  7.79589e-05  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  84.62 
 
 
247 aa  431  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  74.49 
 
 
247 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  62.4 
 
 
246 aa  312  3e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3555  ABC transporter-like protein  61.54 
 
 
247 aa  308  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.836989  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  60.82 
 
 
249 aa  305  5e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61 
 
 
249 aa  304  9e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  58.51 
 
 
249 aa  303  2e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9351  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.13 
 
 
247 aa  303  2e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.17 
 
 
244 aa  303  2e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  59.5 
 
 
242 aa  302  3e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6886  ABC transporter related  61.07 
 
 
254 aa  301  5e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  59.5 
 
 
242 aa  301  6e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  58.58 
 
 
240 aa  300  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  58.68 
 
 
242 aa  298  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  60.17 
 
 
260 aa  298  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  57.85 
 
 
242 aa  298  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  56.9 
 
 
243 aa  295  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.69 
 
 
242 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  60.25 
 
 
242 aa  295  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.85 
 
 
244 aa  294  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  58.16 
 
 
241 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  57.74 
 
 
241 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.92 
 
 
244 aa  293  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  57.74 
 
 
241 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  56.49 
 
 
243 aa  293  2e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  57.26 
 
 
260 aa  292  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.32 
 
 
246 aa  292  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  57.74 
 
 
241 aa  291  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  57.74 
 
 
241 aa  291  7e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.74 
 
 
240 aa  291  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.17 
 
 
278 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  56.61 
 
 
242 aa  290  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  55.23 
 
 
247 aa  290  1e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.31657e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  60.08 
 
 
241 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  58.16 
 
 
243 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  56.07 
 
 
243 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  57.08 
 
 
241 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
241 aa  289  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.41 
 
 
240 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  57.08 
 
 
241 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  60.17 
 
 
240 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  58.78 
 
 
273 aa  289  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.74 
 
 
240 aa  288  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.6 
 
 
247 aa  288  4e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.77 
 
 
246 aa  288  4e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 
253 aa  288  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59 
 
 
258 aa  288  4e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  56.2 
 
 
252 aa  288  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  56.67 
 
 
241 aa  288  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  57.08 
 
 
252 aa  288  7e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  2.53123e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55.42 
 
 
242 aa  288  7e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.07 
 
 
240 aa  287  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  55.65 
 
 
240 aa  287  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
253 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  53.14 
 
 
242 aa  287  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.6676e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  56.79 
 
 
244 aa  286  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  59.66 
 
 
241 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.49 
 
 
240 aa  286  3e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  58.02 
 
 
252 aa  285  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.19 
 
 
244 aa  285  5e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  57.32 
 
 
257 aa  285  7e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  54.81 
 
 
363 aa  284  8e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  54.81 
 
 
363 aa  284  8e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  57.74 
 
 
239 aa  284  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.09698e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  55.65 
 
 
240 aa  284  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  56.49 
 
 
243 aa  284  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  56.49 
 
 
241 aa  284  1e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  58.9 
 
 
240 aa  283  1e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  59.24 
 
 
241 aa  283  2e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  57.08 
 
 
269 aa  283  2e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  55.83 
 
 
257 aa  283  2e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  57.74 
 
 
240 aa  282  3e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  55.97 
 
 
248 aa  282  3e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  58.51 
 
 
249 aa  282  3e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  53.14 
 
 
240 aa  282  3e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.84 
 
 
242 aa  282  3e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  56.07 
 
 
241 aa  282  4e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  57.63 
 
 
252 aa  282  4e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  56.67 
 
 
262 aa  281  6e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  57.32 
 
 
240 aa  281  6e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  57.08 
 
 
243 aa  281  6e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 
251 aa  281  6e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.07 
 
 
240 aa  281  7e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  9.46147e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  57.5 
 
 
243 aa  281  7e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 
240 aa  281  8e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  57.14 
 
 
247 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  55 
 
 
240 aa  280  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  55.42 
 
 
241 aa  280  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  5.58421e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  54.39 
 
 
246 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 
244 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 
240 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  53.14 
 
 
246 aa  280  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  55.88 
 
 
248 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  56.79 
 
 
243 aa  279  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  54.39 
 
 
257 aa  279  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  58.65 
 
 
247 aa  278  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  53.72 
 
 
247 aa  279  4e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.70097e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  56.67 
 
 
243 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>