More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2575 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  470  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3517  Type II site-specific deoxyribonuclease  57.86 
 
 		 191 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  unclonable  0.00000000301458  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0456  Type II site-specific deoxyribonuclease  57.42 
 
 		 187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  49.3 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  58.82 
 
 		 77 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  58.82 
 
 		 77 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  47.06 
 
 		 77 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  54.55 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  58.46 
 
 		 93 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  46.43 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  50.82 
 
 		 75 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  52.94 
 
 		 96 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 78 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 74 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 120 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 76 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  54.69 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  46.88 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.77 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 110 aa  62  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 390 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6540  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 113 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 76 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  45.71 
 
 		 87 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  54.55 
 
 		 80 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 91 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  47.76 
 
 		 82 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 72 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  49.15 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  50.91 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  50.91 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 57 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  52.54 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  50.79 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 76 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  45.16 
 
 		 86 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 78 aa  58.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 76 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 76 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 85 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  48.53 
 
 		 68 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  42.42 
 
 		 67 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 68 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 77 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 84 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  48.53 
 
 		 68 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  48.53 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4969  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1957  transcriptional regulator, XRE family  45.57 
 
 		 89 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 85 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 120 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 91 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 86 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  45.59 
 
 		 75 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1786  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 82 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.365144  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 94 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 76 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 71 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 72 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 505 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 69 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 69 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 69 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  45.31 
 
 		 68 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 81 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 72 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0669  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 75 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 84 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 500 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 78 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 78 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 67 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>