More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2537 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2537  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  786  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00283871  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1173  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  40.73 
 
 
393 aa  285  8e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.760963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1076  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.45 
 
 
393 aa  283  4e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7508  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  40 
 
 
384 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0612  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.4 
 
 
400 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0049  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.11 
 
 
419 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2714  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.68 
 
 
419 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.395305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2665  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.68 
 
 
419 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0056  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.68 
 
 
419 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1838  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.68 
 
 
419 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0057  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.68 
 
 
419 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3289  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.68 
 
 
419 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0270  hypothetical protein  29.39 
 
 
419 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494992  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4455  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.81 
 
 
417 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0616202  normal  0.0186598 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.25 
 
 
425 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  23.89 
 
 
386 aa  83.2  7e-15  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  2.67349e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 
377 aa  82.8  9e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  23.82 
 
 
370 aa  72.8  9e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
374 aa  72.4  1e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 
370 aa  70.5  4e-11  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 
374 aa  70.5  5e-11  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  24.63 
 
 
370 aa  70.5  5e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  23.05 
 
 
373 aa  69.3  1e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  22.95 
 
 
368 aa  69.3  1e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
403 aa  68.6  2e-10  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
401 aa  67  6e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 
398 aa  65.1  2e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  22.09 
 
 
378 aa  64.7  3e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  41.38 
 
 
393 aa  64.3  3e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  24.36 
 
 
398 aa  64.3  4e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  34.86 
 
 
397 aa  63.9  5e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  22.61 
 
 
394 aa  63.5  6e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0852  hypothetical protein  24.33 
 
 
451 aa  63.2  7e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  39.13 
 
 
399 aa  63.2  8e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 
383 aa  62.8  9e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  22.36 
 
 
367 aa  61.6  2e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  24.43 
 
 
382 aa  62  2e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
392 aa  60.8  4e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  23.82 
 
 
407 aa  60.8  4e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  21.32 
 
 
400 aa  60.1  6e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  35.11 
 
 
396 aa  60.1  6e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  35.11 
 
 
396 aa  60.5  6e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  22.26 
 
 
377 aa  59.3  1e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  24.61 
 
 
381 aa  59.3  1e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 
388 aa  58.2  2e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  22.26 
 
 
377 aa  58.9  2e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  24.16 
 
 
372 aa  57.8  3e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  21.53 
 
 
393 aa  57.8  3e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 
389 aa  57.8  4e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  38.38 
 
 
386 aa  57.4  4e-07  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  32.58 
 
 
383 aa  57.4  4e-07  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.29 
 
 
402 aa  57  6e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4823  extracellular ligand-binding receptor  24.12 
 
 
437 aa  57  6e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  22.45 
 
 
376 aa  56.2  8e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  24.16 
 
 
368 aa  56.2  9e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  24.68 
 
 
381 aa  55.8  1e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  23.31 
 
 
372 aa  55.8  1e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 
373 aa  55.5  1e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.18 
 
 
393 aa  55.5  1e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4394  extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 
406 aa  56.2  1e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4000  Extracellular ligand-binding receptor  23.34 
 
 
403 aa  55.8  1e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 
379 aa  55.8  1e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 
384 aa  55.8  1e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  21.2 
 
 
389 aa  55.1  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  39.76 
 
 
394 aa  55.1  2e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  27.12 
 
 
382 aa  55.1  2e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  24.56 
 
 
372 aa  55.1  2e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  22.57 
 
 
409 aa  55.1  2e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3889  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 
541 aa  55.1  2e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 
385 aa  54.7  3e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  20.39 
 
 
379 aa  54.7  3e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1574  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  27 
 
 
409 aa  54.3  3e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.760294  normal  0.703114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 
400 aa  54.7  3e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 
368 aa  54.7  3e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 
385 aa  54.7  3e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 
390 aa  54.3  4e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  23.57 
 
 
396 aa  54.3  4e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.52 
 
 
380 aa  54.3  4e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  25.55 
 
 
384 aa  53.9  4e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5667  putative Leu/Ile/Val/Thr-binding protein precursor; putative signal peptide  37.74 
 
 
447 aa  54.3  4e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  23.66 
 
 
381 aa  53.9  5e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 
397 aa  53.9  5e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  24.32 
 
 
371 aa  53.9  5e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  24.15 
 
 
387 aa  53.5  6e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  24.91 
 
 
382 aa  53.1  7e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 
376 aa  53.1  7e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  5.68006e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  24.68 
 
 
379 aa  53.1  8e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4684  extracellular ligand-binding receptor  21.2 
 
 
406 aa  53.1  8e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  33.67 
 
 
396 aa  53.1  8e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2954  hypothetical protein  36.36 
 
 
415 aa  53.1  8e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  40.51 
 
 
396 aa  52.8  9e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 
384 aa  53.1  9e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4590  Extracellular ligand-binding receptor  24.64 
 
 
441 aa  52.4  1e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  44 
 
 
436 aa  52.4  1e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 
400 aa  52.8  1e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  22 
 
 
374 aa  52.4  1e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  25.09 
 
 
395 aa  52.4  1e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1005  extracellular ligand-binding receptor  24.69 
 
 
407 aa  52.8  1e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.66 
 
 
374 aa  52.4  1e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  22.77 
 
 
368 aa  52.8  1e-05  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>