More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2504 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  275  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  60.94 
 
 		 136 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  59.42 
 
 		 141 aa  173  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  64.84 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  54.96 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  63.11 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  65.57 
 
 		 137 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  63.71 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  62.1 
 
 		 138 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  64.8 
 
 		 141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  60 
 
 		 137 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  60.48 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  58.87 
 
 		 127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  51.94 
 
 		 140 aa  151  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  53.17 
 
 		 140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  51.94 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  58.06 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  55.37 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  51.64 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  64.89 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  49.6 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  52.5 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  49.59 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  48.33 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  45.38 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.86 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  41.6 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  41.73 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  40.8 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  40.48 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  44.53 
 
 		 345 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  37.3 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  38.4 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  42.15 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  40.48 
 
 		 346 aa  90.5  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  41.27 
 
 		 346 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  64.62 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  46.39 
 
 		 344 aa  84.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  40.5 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  36.44 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  35.59 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  40.34 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  35.61 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  33.06 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  32.77 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  35.16 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  34.17 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  39.58 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.72 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  31.93 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  33.88 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 		 323 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.75 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  36.61 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  34.35 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  33.06 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  35.43 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 		 204 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  34.91 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  33.87 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  35.25 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  35.25 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  35.25 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  35.25 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  31.4 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.77 
 
 		 389 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  30.4 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  42.05 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  30.58 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  35.38 
 
 		 438 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  36.94 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 		 476 aa  60.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  40.66 
 
 		 346 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  35.65 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  30.33 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  31.75 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  30.33 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  36.04 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  30.08 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  36.04 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  29.23 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  31.15 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  37.01 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  30.89 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  36.08 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  31.93 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  31.53 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  37.61 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>