166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2445 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  100 
 
 
198 aa  373  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  2.83482e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  59.8 
 
 
197 aa  204  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  52.04 
 
 
205 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  51.01 
 
 
206 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  52.13 
 
 
192 aa  148  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  44.39 
 
 
203 aa  131  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  48.13 
 
 
199 aa  130  1e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  44.39 
 
 
195 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  42.49 
 
 
197 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  41.55 
 
 
207 aa  118  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  44.92 
 
 
197 aa  116  2e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  45.95 
 
 
205 aa  114  7e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  44.94 
 
 
191 aa  113  2e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  44.94 
 
 
200 aa  104  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  46.37 
 
 
189 aa  104  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  41.84 
 
 
197 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  45.36 
 
 
205 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  42.78 
 
 
191 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  42.78 
 
 
191 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  44.68 
 
 
196 aa  98.6  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  35.71 
 
 
190 aa  97.8  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  4.21582e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  41.62 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  46.52 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  41.41 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  42.26 
 
 
204 aa  91.3  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  38.31 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  43.82 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  39.01 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  44.67 
 
 
208 aa  85.9  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  37.42 
 
 
182 aa  83.2  2e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  9.40294e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  37.85 
 
 
190 aa  82.8  3e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  33.53 
 
 
184 aa  79.3  3e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  39.63 
 
 
185 aa  79  4e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  35.94 
 
 
200 aa  79  5e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  42 
 
 
187 aa  78.2  7e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  36.11 
 
 
184 aa  78.2  7e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  37.2 
 
 
215 aa  77.8  1e-13  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  36.59 
 
 
215 aa  77  2e-13  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  8.44147e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  35.19 
 
 
191 aa  75.9  3e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  33.15 
 
 
196 aa  75.5  4e-13  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  34.91 
 
 
175 aa  75.9  4e-13  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  45.37 
 
 
195 aa  75.1  7e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  35.26 
 
 
189 aa  75.1  7e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  35.8 
 
 
191 aa  74.7  8e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.66456e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  35.19 
 
 
191 aa  74.7  9e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  7.0307e-10  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  37.65 
 
 
191 aa  73.9  1e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  4.23922e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  37.65 
 
 
191 aa  73.9  1e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  36.06 
 
 
231 aa  73.6  2e-12  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  36.42 
 
 
191 aa  72.8  3e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  38.04 
 
 
185 aa  72  5e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  36.42 
 
 
191 aa  70.5  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  5.93466e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1274  BioY protein  38.32 
 
 
196 aa  70.9  1e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  36.42 
 
 
191 aa  70.5  1e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  35.03 
 
 
210 aa  70.9  1e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  33.33 
 
 
187 aa  70.9  1e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  36.42 
 
 
191 aa  70.5  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.18504e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  38.36 
 
 
145 aa  70.9  1e-11  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  39.55 
 
 
199 aa  70.5  2e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  33.33 
 
 
178 aa  70.1  2e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  35.19 
 
 
191 aa  69.7  3e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  38.07 
 
 
187 aa  68.9  5e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  36.59 
 
 
215 aa  68.2  8e-11  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  3.30178e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  32.47 
 
 
199 aa  67.8  1e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  36.36 
 
 
195 aa  67.4  1e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  36.73 
 
 
182 aa  67  2e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.2911e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  38.55 
 
 
189 aa  66.2  3e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  29.81 
 
 
184 aa  65.5  5e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.66759e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  39.58 
 
 
169 aa  65.5  5e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  34.52 
 
 
212 aa  65.1  6e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  36.65 
 
 
201 aa  65.1  6e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  33.85 
 
 
199 aa  65.1  7e-10  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  33.85 
 
 
199 aa  65.1  7e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  35.37 
 
 
182 aa  63.9  1e-09  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  38 
 
 
187 aa  64.7  1e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.89963e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  38.83 
 
 
202 aa  63.9  1e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.12957e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  37.24 
 
 
169 aa  62.4  4e-09  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  36.49 
 
 
187 aa  62.4  4e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  30.82 
 
 
165 aa  62.8  4e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  37.24 
 
 
169 aa  62.4  4e-09  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  31.61 
 
 
192 aa  62.4  5e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  44.59 
 
 
180 aa  62  5e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  38.13 
 
 
179 aa  62  6e-09  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  32.28 
 
 
167 aa  60.1  2e-08  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.11141e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  38.55 
 
 
192 aa  60.5  2e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  37.78 
 
 
182 aa  59.3  3e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  44.07 
 
 
193 aa  59.7  3e-08  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  40 
 
 
216 aa  58.9  5e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  33.69 
 
 
181 aa  58.5  6e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  40.14 
 
 
224 aa  57.4  1e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  36.6 
 
 
187 aa  57.4  1e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  32.26 
 
 
182 aa  57.8  1e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  36.17 
 
 
187 aa  56.6  2e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  34.48 
 
 
179 aa  57  2e-07  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  9.49175e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  34.87 
 
 
189 aa  56.6  2e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  29.49 
 
 
197 aa  57  2e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.12597e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  29.49 
 
 
197 aa  56.6  2e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  29.49 
 
 
197 aa  56.6  2e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  3.60294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  33.55 
 
 
174 aa  57  2e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  7.75885e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  37.24 
 
 
180 aa  57  2e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  32.79 
 
 
189 aa  56.6  2e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>