More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2440 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 270 aa  543  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  69.57 
 
 		 253 aa  353  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 272 aa  288  6e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  47.45 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  45.63 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  46.48 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  47.45 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  41.03 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  41.86 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  46.48 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  43.02 
 
 		 262 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  46.09 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  46.4 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  46.48 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  45.78 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  46.4 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  46.4 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 265 aa  198  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.11 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  38.49 
 
 		 409 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  43.08 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  40.57 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  40.6 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  42.31 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  45.67 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  42.32 
 
 		 262 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  44.53 
 
 		 255 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  44.71 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  42.29 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  39.04 
 
 		 424 aa  186  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.57 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  41.47 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.76 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  44.77 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  43.41 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.58 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  41.56 
 
 		 293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  47.6 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  42.29 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  41.57 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  44.02 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  41.15 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  41.15 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  41.15 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  40.47 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  42.75 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  46.48 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  44.4 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  42.31 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  43.44 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  43.72 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  40.74 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  40.4 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  40.56 
 
 		 268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  40 
 
 		 321 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  40.82 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  40.24 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  40.39 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  40.39 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  40.39 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  34.39 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.99 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  46.09 
 
 		 255 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  38.7 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  43.14 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  39.6 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  37.18 
 
 		 418 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  41.38 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.16 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  46.09 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0548  ABC transporter-related protein  41.22 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  44.53 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  36.76 
 
 		 455 aa  175  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  37.36 
 
 		 264 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.78 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  37.25 
 
 		 414 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  40.94 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  42.26 
 
 		 384 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  41.23 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  42.35 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  40.51 
 
 		 444 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  42.02 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  43.41 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  43.55 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0023  ABC transporter related  45.31 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  41.15 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 264 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>