26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2406 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2406  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  703    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1844  hypothetical protein  63.11 
 
 
346 aa  424  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1318  hypothetical protein  40.12 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.444184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2433  hypothetical protein  38.73 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21680  hypothetical protein  38.01 
 
 
335 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.2828  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0423  hypothetical protein  39.88 
 
 
337 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0080  hypothetical protein  35.96 
 
 
336 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.723937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2104  hypothetical protein  37.35 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0200  hypothetical protein  37.06 
 
 
333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0177  hypothetical protein  40.81 
 
 
345 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022221 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3934  hypothetical protein  39.21 
 
 
350 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0114  hypothetical protein  38.82 
 
 
164 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0101503  hitchhiker  0.00333564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2650  hypothetical protein  31.6 
 
 
353 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0257  hypothetical protein  38.61 
 
 
332 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  hitchhiker  0.00111717 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3215  hypothetical protein  38.84 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000550519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1569  hypothetical protein  29.85 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4513  hypothetical protein  35.14 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5160  hypothetical protein  29.81 
 
 
523 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417539  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0191  hypothetical protein  35.06 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6760  hypothetical protein  30.25 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3440  hypothetical protein  28.37 
 
 
355 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00117447  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.25 
 
 
387 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2993  hypothetical protein  23.3 
 
 
511 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.300626  normal  0.564635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2955  peptidase  41.94 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3177  peptidase  38.39 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4685  hypothetical protein  26.49 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192913  normal  0.0818693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>