73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2403 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  100 
 
 
400 aa  801    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  44.61 
 
 
415 aa  286  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  38.5 
 
 
410 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  33.74 
 
 
409 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  38.08 
 
 
444 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  36.59 
 
 
427 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  30.96 
 
 
431 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  28.95 
 
 
420 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  31.62 
 
 
415 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  34.17 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  34.48 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  33 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  31.45 
 
 
411 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  29.51 
 
 
411 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  30.71 
 
 
411 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  27.99 
 
 
433 aa  180  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  31.03 
 
 
420 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  31.11 
 
 
408 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  29.63 
 
 
413 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  31.08 
 
 
412 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  27.75 
 
 
433 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  29.38 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  31.75 
 
 
407 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  32.43 
 
 
409 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  28.99 
 
 
407 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  30.32 
 
 
407 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  32.19 
 
 
409 aa  169  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  30.42 
 
 
408 aa  169  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  32.51 
 
 
409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  29.13 
 
 
408 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  29.28 
 
 
407 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  31.56 
 
 
410 aa  159  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  29.98 
 
 
408 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  29.28 
 
 
407 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  30.96 
 
 
409 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  28.26 
 
 
400 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  28.78 
 
 
407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  28.54 
 
 
407 aa  156  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  30.6 
 
 
406 aa  156  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  28.31 
 
 
418 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  29.93 
 
 
411 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  27.65 
 
 
402 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  29.07 
 
 
406 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  32.28 
 
 
373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  30.71 
 
 
438 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  27.43 
 
 
413 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  29.78 
 
 
416 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  29.83 
 
 
413 aa  135  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  26.67 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  26.91 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  24.94 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  23.98 
 
 
416 aa  119  9e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  22.95 
 
 
436 aa  109  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  24.13 
 
 
400 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  24.13 
 
 
400 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  22.03 
 
 
409 aa  106  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  19.9 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  26.85 
 
 
817 aa  83.2  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  23.04 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  20.67 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  20.67 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  29.45 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  24.26 
 
 
359 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  24.44 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  23.14 
 
 
396 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  22.02 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  39.36 
 
 
376 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  21.58 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  21.04 
 
 
402 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  19.89 
 
 
396 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  21.24 
 
 
406 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  23.32 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>