More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2378 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2378  inner-membrane translocator  100 
 
 		 304 aa  576  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2444  inner-membrane translocator  86.84 
 
 		 304 aa  462  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  45.36 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0544  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 293 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  46 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  36.09 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0137  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 302 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 297 aa  172  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2425  inner-membrane translocator  43.61 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4063  inner-membrane translocator  40.66 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  34.42 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  35.39 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.43 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 		 294 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  36.66 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 290 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  35.55 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.93 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0031  inner-membrane translocator  41.31 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2359  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.538804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  38.03 
 
 		 293 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5147  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  33.89 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  34.1 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2307  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1437  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522267  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3609  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  35.67 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0785  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 309 aa  135  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  30.23 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0376  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  33.13 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5008  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0115  inner-membrane translocator  29.88 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4006  inner-membrane translocator  30.49 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2219  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 329 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.515204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0050  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.681115 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0216  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  29.33 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.1 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.35 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 294 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2723  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956007  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3164  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109839  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  29.28 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  29.13 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0262  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.84 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3363  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5288  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.653195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 294 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2277  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.83 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>