More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2349 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 		 194 aa  377  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  57.22 
 
 		 206 aa  201  8e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  44.64 
 
 		 198 aa  147  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  38.98 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  39.39 
 
 		 259 aa  121  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  39.43 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  38.38 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  36.26 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  35.54 
 
 		 256 aa  118  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  37.84 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  36.88 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  37.7 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.85 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  33.17 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.71 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  36.07 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  36.31 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  30.9 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  35.71 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  36.63 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  34.05 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.05 
 
 		 226 aa  104  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  33.12 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  36.47 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.44 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  36.42 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  37.63 
 
 		 218 aa  101  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  34.55 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  34.66 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2124  hypothetical protein  37.65 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  34.59 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  35.62 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  34.67 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  34.18 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  34.36 
 
 		 224 aa  99.4  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  31.49 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  37.06 
 
 		 241 aa  98.2  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  32.28 
 
 		 218 aa  97.8  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  32.43 
 
 		 213 aa  97.8  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  35.09 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  37.35 
 
 		 363 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.37 
 
 		 286 aa  97.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.24 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  34.39 
 
 		 227 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  38.82 
 
 		 234 aa  95.9  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0210  hypothetical protein  34.13 
 
 		 228 aa  95.9  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  39.04 
 
 		 246 aa  95.9  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  35.23 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  32.58 
 
 		 229 aa  95.1  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  37.09 
 
 		 219 aa  95.1  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  34.66 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  32.61 
 
 		 219 aa  94.7  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  34.25 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  35.5 
 
 		 253 aa  94.4  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  33.93 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  33.95 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  31.63 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  33.93 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  32.99 
 
 		 230 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  32.62 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4363  putative integral membrane protein  36.46 
 
 		 231 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0242225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  33.14 
 
 		 214 aa  92.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  33.13 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  33.78 
 
 		 220 aa  92  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  32.65 
 
 		 244 aa  92  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  32.02 
 
 		 237 aa  92  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  32.72 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  34.16 
 
 		 230 aa  91.7  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  31 
 
 		 222 aa  91.3  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  34.52 
 
 		 215 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  31.61 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  32.56 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  33.15 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  31.91 
 
 		 223 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  32.73 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  33.33 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  35.5 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  32.75 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  35.5 
 
 		 283 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  32.6 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  28.49 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  35.5 
 
 		 242 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  35.5 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  35.5 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  33.7 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  35.47 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  35.5 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  35.5 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  32.04 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  31.49 
 
 		 279 aa  89  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4005  hypothetical protein  36.41 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  33.77 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  34.3 
 
 		 218 aa  88.6  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  33.88 
 
 		 227 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  33.11 
 
 		 222 aa  88.2  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  31.71 
 
 		 217 aa  87.8  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  33.8 
 
 		 223 aa  87.8  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  34.23 
 
 		 235 aa  87.8  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>